Il s'agit de l'application Linux nommée popoolation dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom popoolation_1.2.2.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée popoolation avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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regroupement
DESCRIPTION
PoPoolation est un pipeline permettant d'analyser les données de séquençage de nouvelle génération regroupées. Actuellement PoPoolation permet de calculer le Pi de Tajima, le Theta de Watterson et le D de Tajima avec une approche de fenêtre glissante pour les chromosomes ou pour un ensemble de gènes. L'un des principaux défis de la génomique des populations est d'identifier les régions d'intérêt à l'échelle du génome. Nous pensons que PoPoolation facilitera grandement cette tâche en permettant une analyse rapide et conviviale des données NGS à partir des pools d'ADN.Documentation: https://sourceforge.net/p/popoolation/wiki/Main/
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/popoolation/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
