Il s'agit de l'application Linux nommée PPIXpress à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom PPIXpress_1.23.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée PPIXpress pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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PPIXpress pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
Bien que les réseaux d'interaction protéine-protéine soient une composante omniprésente de la biologie des systèmes modernes, relativement peu d'efforts ont été faits pour adapter leur topologie à l'état cellulaire réel à l'étude. Puisqu'une simple réduction des réseaux au sous-ensemble de gènes exprimés ne fait qu'effleurer la surface des capacités de régulation des organismes supérieurs, nous proposons la méthode avancée PPIXpress qui permet d'exploiter les données d'expression au niveau du transcrit et est ainsi capable de révéler également des altérations dans connectivité des protéines causée par l'épissage alternatif.La publication originale se trouve sur https://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/4/571 .
Comment ça marche
- construction automatique de réseaux d'interaction protéine-protéine
Audience
Industrie de la santé, Science/Recherche
Interface utilisateur
Java Swing, console/terminal, ligne de commande
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/ppixpress/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
