Il s'agit de l'application Linux proSeq, dont la dernière version est téléchargeable sous le nom proseq4.2_win64.zip. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée proSeq avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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proSeq
DESCRIPTION
ProSeq (« Processeur de séquences ») est un package comprenant des programmes d'interface graphique et de ligne de commande pour traiter et analyser les données de polymorphisme de l'ADN.
Il permet d'ouvrir et d'enregistrer des données de séquence dans plus d'une douzaine de formats de fichiers (et de les convertir entre eux). Il affiche les alignements de séquences dans une fenêtre graphique et permet à l'utilisateur de modifier, de manipuler et d'analyser les séquences de diverses manières.
ProSeq4 comprend des outils permettant d'analyser le polymorphisme de l'ADN, de rechercher une sélection, de réaliser une PCA et de reconstruire des phylogénies à partir de données de séquence ou de SNP.
Le programme peut également exécuter des simulations coalescentes et générer et visualiser des phylogénies.
Les principaux changements dans Proseq4 par rapport à Proseq3 :
- Multiplateforme. Binaires disponibles pour Windows, Mac et Ubuntu.
- Il s'agit désormais d'un programme 64 bits, capable de gérer des ensembles de données plus volumineux (à l'échelle du génome de plusieurs individus).
- TreeViewer peut afficher plusieurs phylogénies dans un style de type densiTree
- Analyse en composantes principales
Avis de non-responsabilité : Aucune garantie d'aucune sorte n'est fournie - utilisez-le à vos propres risques
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/proseq/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
