Il s'agit de l'application Linux nommée RNASeq-MATS dont la dernière version peut être téléchargée sous rmats2sashimiplot_test_data.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée RNASeq-MATS avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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RNASeq-MATS
DESCRIPTION
MATS est un outil informatique permettant de détecter des événements d'épissage alternatif différentiel à partir de données RNA-Seq. Le modèle statistique de MATS calcule la valeur P et le taux de fausses découvertes selon lesquels la différence du rapport isoforme d'un gène entre deux affections dépasse un seuil défini par l'utilisateur. À partir des données RNA-Seq, MATS peut détecter et analyser automatiquement les événements d'épissage alternatif correspondant à tous les principaux types de modèles d'épissage alternatif. MATS gère les données RNA-Seq répliquées à partir d'un plan d'étude apparié et non apparié. Plus d'informations peuvent être trouvées sur http://rnaseq-mats.sourceforge.net.
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/rnaseq-mats/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
