Il s'agit de l'application Linux nommée SPiCEv2.1 à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom SPiCEtoLinux.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée SPiCEv2.1 pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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SPiCEv2.1 pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
SPiCEv2.1 est un outil permettant de prédire l'altération d'épissage d'un variant survenant dans le site d'épissage consensus (donneur : -3 ; +6 et accepteur : -12 ; +2).Vous pouvez également télécharger SPiCE pour Win 64 bits : https://sourceforge.net/projects/spicev2-1/files/SPiCEInstall64bit.exe/download
Vous pouvez également télécharger SPiCE pour Win 32 bits : https://sourceforge.net/projects/spicev2-1/files/SPiCEInstall32bit.exe/download
Vous pouvez également télécharger SPiCE pour Linux : https://sourceforge.net/projects/spicev2-1/files/SPiCEtoLinux.zip/download
Si vous avez des questions, veuillez me contacter à : [email protected] or [email protected]
v2.1.5 (05/2019) + corr (01/2020) :
Correction d'un bug pour la version Linux
v2.1.4 (03/2019) :
Gestion des proxys (uniquement pour la version Windows)
v2.1.3 (07/2018) :
bug de correction pour les 3 premiers ss
importer un fichier vcf
v2.1.2 (06/2018) :
Importer la duplication
Importation simplifiée de la délétion avec un nucléotide
Utiliser tryCatch
Amélioration de la vérification de la connexion à l'API Web
Fonctionnalités:
- Prédiction
- Variantes
- épissure
- ARN
- Région de consensus
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Tk
Langage de programmation
B / R
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/spicev2-1/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.