Il s'agit de l'application Linux nommée The Protein Similarity Network dont la dernière version peut être téléchargée sous PSIN_0.0.2.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée The Protein Similarity Network avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Le réseau de similarité des protéines
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DESCRIPTION
C'est le réseau de similarité des protéines - PSIN. Ici, les nœuds sont des protéines humaines et ils ne sont liés que s'ils partagent une similitude de séquence considérable.
Nous avons constaté que ce réseau est particulièrement utile pour distinguer les cibles médicamenteuses approuvées des cibles problématiques.
Vous trouverez également ici l'ensemble complet des programmes et des ensembles de données que nous avons utilisés à cette fin.
Gratuit pour aider à tester et développer ce projet. Votre aide et votre expertise sont très appréciées !
Si vous avez des questions, n'hésitez pas à nous contacter sur le forum ou par email.
Veuillez consulter le manuscrit original :
Lopes, TJS et al. (2015) - "Identifier les drogues problématiques en fonction des caractéristiques de leurs cibles" - Frontiers in Pharmacology doi : 10.3389/fphar.2015.00186
Audience
Industrie de la santé, Science/Recherche, Utilisateurs finaux avancés
Langage de programmation
Perl, Java, S/R
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/psin/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
