Il s'agit de l'application Linux nommée TUIT à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom tuit.1.0.4.1.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée TUIT pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
TUIT pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Pour les instructions d'installation, veuillez consulter la page Wiki : https://sourceforge.net/p/tuit/wiki/IMPORTANT: depuis la version 1.0.4.0 TUIT permet de sélectionner une sortie formatée de type RDP pour améliorer
compatibilité immédiate avec les outils, qui supposent une entrée au format RDP.
Un nouveau champ a été ajouté au fichier properties.xml, veuillez vous assurer de le mettre à jour pour qu'il contienne
ou dans le section.
Lisez notre article dans Biotechniques : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24502797
L'outil d'identification des unités taxonomiques (TUIT) est un logiciel gratuit et indépendant de la plate-forme, conçu spécifiquement pour faciliter l'annotation taxonomique des séquences nucléotidiques via la recherche d'homologie BLAST par rapport aux bases de données NCBI. TUIT est immédiatement applicable à la fois aux études de microboime 16S ainsi qu'à la classification taxonomique des lectures de nucléotides. Veuillez consulter la page Wiki du projet.
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Java
Environnement de base de données
JDBC, basé sur SQL
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/tuit/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
