Il s'agit de l'application Linux nommée ViReMa dont la dernière version peut être téléchargée sous ViReMa_0.25.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée ViReMa avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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ViReMa
DESCRIPTION
ViReMa (Viral Recombination Mapper) détecte et signale les événements de recombinaison ou de fusion dans les génomes viraux à l'aide d'ensembles de données de séquençage approfondi.
Février 2014 - Notre article (Open Access) est disponible sur Nucleic Acids Research :
"Découverte de motifs génomiques fonctionnels dans les virus avec ViReMa - un mappeur de recombinaison de virus - pour l'analyse des données de séquençage de nouvelle génération"
http://nar.oxfordjournals.org/content/42/2/e11
Il s'agit d'un projet en cours et des mises à jour seront régulièrement publiées. Veuillez nous contacter pour toute question, problème ou suggestion.
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Python
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/virema/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
