Il s'agit de l'application Linux nommée Virus dont la dernière version peut être téléchargée en tant que Qspp_v1.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Virus avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
virus
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DESCRIPTION
Modèle de simulation stochastique de la transition d'état génétique du poliovirus Sabin-à-Mahoney (code C++). Modèles de génotypes, de populations de virus et de nuages de quasi-espèces. Simule une erreur de réplication et une recombinaison de choix de copie. Divers paramètres guidant le modèle sont spécifiés par l'utilisateur. Le code Python post-traite la sortie de simulation pour produire des fichiers de rapport.
Fonctionnalités:
- Simule l'erreur de réplication de Picornavirus et la recombinaison de choix de copie
- Représente les génotypes, les populations cellulaires et le nuage de quasi-espèces
- Permet à l'utilisateur de contrôler les paramètres : MOI, taux d'erreur de réplication, taux de recombinaison, taux de croissance générationnelle, taille de la rafale, nombre de passages, nombre de cellules, accélération de la forme physique, synergie mutationnelle Mahoney
- Rapporte la diversité de la population, la forme physique moyenne, la neurovirulence, la ressemblance de Mahoney
Audience
Science/Recherche, Éducation, Utilisateurs finaux avancés, Développeurs
Langage de programmation
Python, C++
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/qspp-modeling/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
