Il s'agit de l'application Windows nommée 123VCF dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom 123VCF_binary.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée 123VCF avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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123VCF
DESCRIPTION
123VCF a été développé pour rendre l'étape de filtrage des fichiers VCF plus fiable et efficace.
Il peut être utilisé dans l'étape la plus importante du séquençage de l'exome entier et de l'analyse des données de séquençage du génome entier dans la recherche et également en milieu clinique.
Il obtient simplement le fichier de commande de filtration et le fichier de variantes, puis filtre les variantes en fonction de ce que vous avez commandé via le fichier de commande de filtration.
Manuel utilisateur:
https://dl.adbioinformatics.net/123VCF/123VCF_Manual.ver1.pdf
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Auteurs : Milad Eidi, Samaneh Abdolalizadeh, Soheila Moeini
Superviseurs : Javad Zahiri, PhD - Masoud Garshasbi, PhD
Fonctionnalités:
- Interface utilisateur graphique
- Facile à utiliser
- Facile à comprendre
- Fichiers VCF compressés ou non compressés en entrée
- Variantes survivantes présentes au format VCF, format séparé par des tabulations
- 123VCF place les mêmes variantes de fonctionnalités BED lorsque l'utilisateur définit un filtre BED côte à côte dans un fichier TSV pour détecter d'éventuelles variantes hétérozygotes composées
Audience
Éducation, utilisateurs finaux avancés, utilisateurs finaux/ordinateurs de bureau, testeurs
Interface utilisateur
Balançoire Java
Langage de programmation
Java
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/project123vcf/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
