Il s'agit de l'application Windows nommée MAGECK dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom broadgpp-brunello-library-corrected.txt.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MAgeCK avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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MAGECK
DESCRIPTION
L'analyse basée sur un modèle de CRISPR-Cas9 Knockout à l'échelle du génome (MAGeCK) est un outil informatique permettant d'identifier des gènes importants à partir de la récente technologie d'écrans knock-out CRISPR-Cas9 à l'échelle du génome.
Pour les instructions et la documentation, veuillez vous référer à la page wiki.
MAgeCK est développé par Wei Li et Han Xu du laboratoire du Dr Xiaole Shirley Liu au Dana-Farber Cancer Institute/Harvard School of Public Health, et est maintenu par le laboratoire Wei Li du Children's National Medical Center. Nous remercions le soutien du programme Claudia Adams Barr en recherche fondamentale innovante sur le cancer et du NIH/NHGRI pour développer MAGeCK.
Features
- L'algorithme de calcul le plus populaire dans l'analyse de dépistage
- Plus de 400 citations et 60 XNUMX téléchargements
- Pipeline simple et facile à utiliser pour cribler des gènes dans des expériences CRISPR-Cas9 Knockout à l'échelle du génome
- Une documentation complète avec des tutoriels faciles à démarrer
- Haute sensibilité et faible taux de fausses découvertes
- Maintenir activement le code source avec de nouvelles fonctionnalités et des corrections de bugs
- Soutien de la communauté des développeurs et des utilisateurs
- Un ensemble de fonctionnalités de visualisation qui génèrent des chiffres standard de publication
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Python, C
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/mageck/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
