Il s'agit de l'application Windows nommée MS Data Miner à exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée en tant que MDMv.1.3.0.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MS Data Miner pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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MS Data Miner pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne
DESCRIPTION
Le traitement et l'analyse des données dans les études protéomiques est un défi important et prend beaucoup de temps. MS Data Miner (MDM) est un logiciel Web disponible gratuitement pour analyser, traiter, valider, comparer et afficher les fichiers de sortie des logiciels MS, notamment Mascot (Matrix Science), Mascot Distiller (Matrix Science) et ProteinPilot (AB Sciex) . Il a été développé pour réduire considérablement le temps d'analyse des données et pour gérer de grandes études protéomiques.Ce système open source comprend un système de validation des spectres et un outil de génération automatique de captures d'écran pour les spectres attribués à Mascot. De plus, une fonction d'analyse des termes GO et un outil pour générer des rapports de données comparatifs sont inclus.
Le logiciel est décrit dans l'article suivant :
Dyrlund TF, Poulsen ET, Scavenius C, Sanggaard KW, Enghild JJ. MS Data Miner : un outil logiciel basé sur le Web pour analyser, comparer et partager les identifications de protéines par spectrométrie de masse. PROTEOMIQUE 2012
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22833312
Comment ça marche
- Importer des données MS depuis Mascot, Mascot Distiller, ProteinPilot et UniProt
- Prise en charge des données SILAC et iTRAQ
- Validation des spectres des spectres attribués à Mascot
- Génération de captures d'écran des spectres attribués à Mascot
- Analyse des catégories GO term et GO slim
- Génération de rapports de données comparatives
- Créateur de diagramme de Venn
- Partage et accès faciles aux données
- Sélecteur SRM avec créateur de méthode Skyline
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Basée sur le Web
Langage de programmation
ASP
Environnement de base de données
MySQL
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/msdataminer/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
