Il s'agit de l'application Windows nommée Taxoblast dont la dernière version peut être téléchargée en tant que Taxoblast1.21beta.jar. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Taxoblast avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Taxoblaste
DESCRIPTION
Les séquences génomiques brutes sont fréquemment contaminées par des séquences d'autres organismes. Leur identification est essentielle pour l'interprétation des données génomiques. Dans ce contexte, il est essentiel de faire la distinction entre les transferts horizontaux de gènes et la contamination. Le contexte génomique des séquences peut aider à distinguer les deux scénarios. Le taxoblaste divise les échafaudages génomiques en sous-séquences de longueur définie et pour chacun d'eux détermine le taxon apparenté le plus proche. Il résume ensuite ces informations pour l'ensemble de l'échafaudage, en tenant compte de l'ontologie taxonomique. Les échafaudages qui correspondent exclusivement aux contaminants potentiels peuvent être retirés en toute sécurité tandis que les séquences correspondant partiellement aux contaminants et partiellement à l'organisme cible peuvent constituer des transferts horizontaux ou des artefacts d'assemblage et doivent être examinées manuellement.
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Balançoire Java
Langage de programmation
Java
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/taxoblast/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
