यह कमांड ऑटोडॉक4 है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
ऑटोडॉक - रासायनिक लिगेंड को प्रोटीन रिसेप्टर्स से जोड़ना
SYNOPSIS
ऑटोडॉक4 [विकल्पों]
वर्णन
ऑटोडॉक प्रोटीन के लिए रासायनिक यौगिकों की स्वचालित डॉकिंग करता है, अर्थात यह भविष्यवाणी करता है
कैसे छोटे अणु, जैसे सब्सट्रेट या ड्रग उम्मीदवार, ज्ञात 3डी के रिसेप्टर से जुड़ते हैं
संरचना.
AutoDockSuite में दो मुख्य प्रोग्राम शामिल हैं जिनमें से AutoDock डॉकिंग करता है
लक्ष्य प्रोटीन का वर्णन करने वाले ग्रिड के एक सेट के लिए लिगैंड और ऑटोग्रिड पूर्व-गणना करता है
ये ग्रिड.
विकल्प
-p पैरामीटर_फ़ाइलनाम
-l log_filename
-o पुराने पीडीबीक्यू प्रारूप का उपयोग करें, कॉलम 55-61 में क्यू चार्ज करें
-k मूल अवशेष संख्याएँ रखें
-i हेडर-चेकिंग पर ध्यान न दें
-t मरोड़ की जांच करने के लिए पीडीबीक्यू फ़ाइल को पार्स करें, फिर रुकें।
-c < कमांड_फ़ाइल कमांड मोड, फ़ाइल द्वारा
-c | control_program कमांड मोड, control_program द्वारा
उदाहरण
डेबियन पर, निर्देशिका /usr/share/doc/autodock चलाने के लिए उदाहरण प्रदान करती है। उसमें परिवर्तन करें
निर्देशिका और gzipped मानचित्र फ़ाइलों को अनपैक करें (रूट के रूप में), फिर दिखाए गए अनुसार ऑटोडॉक निष्पादित करें
नीचे:
गनज़िप *.map.gz
ऑटोडॉक4 -पी 1पीजीपी.डीपीएफ -एल /टीएमपी/1पीजीपी.डीएलजी
परिणामों की व्याख्या AutoDockTools सुइट द्वारा सहायता प्राप्त है। कृपया इसका भी निरीक्षण करें
ट्यूटोरियल ऑनलाइन पेश किए गए।
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन autodock4 का उपयोग करें
