यह कमांड बैमटूल्स है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
bamtools - BAM (जीनोम संरेखण) फ़ाइलों में हेरफेर करने के लिए टूलकिट
SYNOPSIS
bamtools [--सहायता] आदेश [ARGS]
वर्णन
BamTools BAM फ़ाइलों का उपयोग करके अनुसंधान विश्लेषण और डेटा प्रबंधन की सुविधा प्रदान करता है। यह मुकाबला करता है
वर्तमान अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों द्वारा उत्पादित डेटा की विशाल मात्रा जो आमतौर पर होती है
संपीड़ित, बाइनरी स्वरूपों में संग्रहीत जिन्हें टेक्स्ट-आधारित पार्सर्स द्वारा आसानी से नियंत्रित नहीं किया जाता है
आमतौर पर जैव सूचना विज्ञान अनुसंधान में उपयोग किया जाता है।
विकल्प
बदलना
BAM और कई अन्य प्रारूपों के बीच कनवर्ट करता है
BAM फ़ाइल में संरेखण की प्रिंट संख्या की गणना करें
व्याप्ति
इनपुट BAM फ़ाइल से कवरेज आँकड़े प्रिंट करता है
उपयोगकर्ता-निर्दिष्ट मानदंडों के अनुसार BAM फ़ाइल को फ़िल्टर करें
हेडर BAM हेडर जानकारी प्रिंट करता है
इंडेक्स BAM फ़ाइल के लिए इंडेक्स जेनरेट करता है
मर्ज करें एकाधिक BAM फ़ाइलों को एकल फ़ाइल में मर्ज करें
यादृच्छिक मौजूदा BAM फ़ाइल(फ़ाइलों) से यादृच्छिक संरेखण का चयन करें, जिसका उद्देश्य परीक्षण के रूप में अधिक है
उपकरण.
संकल्प
युग्मित-अंत पाठों का समाधान करता है (आवश्यकतानुसार IsProperPair ध्वज को चिह्नित करना)
रिवर्ट डुप्लिकेट चिह्नों को हटाता है और मूल आधार गुणों को पुनर्स्थापित करता है
सॉर्ट करें कुछ मानदंडों के अनुसार BAM फ़ाइल को सॉर्ट करता है
स्प्लिट उपयोगकर्ता-निर्दिष्ट संपत्ति पर एक BAM फ़ाइल को विभाजित करता है, जिससे एक नई BAM आउटपुट फ़ाइल बनती है
प्रत्येक मान मिला
आँकड़े इनपुट BAM फ़ाइल(फ़ाइलों) से कुछ बुनियादी आँकड़े प्रिंट करता है
किसी विशिष्ट कमांड पर अधिक जानकारी के लिए 'बैमटूल्स हेल्प कमांड' देखें।
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन bamtools का उपयोग करें
