bp_make_mrna_proteinp - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

bp_make_mrna_protein - एक इनपुट mRNA/cDNA अनुक्रम को प्रोटीन में परिवर्तित करें

वर्णन

इनपुट एमआरएनए/सीडीएनए अनुक्रम का उपयोग करके प्रोटीन में परिवर्तित करें अनुवाद करना()

-f/--फ़्रेम फ़्रेम निर्दिष्ट करता है [0,1,2]

कोई यह भी निर्दिष्ट कर सकता है:

-t/--टर्मिनेटर स्टॉप कोडन कैरेक्टर (डिफ़ॉल्ट रूप से '*')
-u/--अज्ञात अज्ञात प्रोटीन वर्ण (डिफ़ॉल्ट रूप से 'X')
-सीडीएस/--फुलएलसीडी अपेक्षित पूर्ण सीडीएस (स्टार्ट और स्टॉप कोडन के साथ)
-throwOnError यदि पूर्ण CDS नहीं है तो थ्रो त्रुटि (डिफ़ॉल्ट रूप से 0)
-if/--प्रारूप इनपुट प्रारूप (FASTA/पियर्सन के लिए डिफ़ॉल्ट)
-of/--प्रारूप आउटपुट स्वरूप (FASTA/पियर्सन के लिए डिफ़ॉल्ट)
-o/--आउटपुट आउटपुट फ़ाइल नाम (डिफ़ॉल्ट रूप से STDOUT)
-i/--इनपुट इनपुट फ़ाइल नाम (STDIN पर डिफ़ॉल्ट)
-ct/--कोडोंटेबल कोडन तालिका का उपयोग करें (डिफ़ॉल्ट रूप से '1')

कोडन तालिकाओं और पर अधिक जानकारी के लिए Bio::PrimarySeq देखें अनुवाद करना() तरीका

लेखक - जेसन स्टैजिचो

जेसन-एट-बायोपर्ल-डॉट-ओआरजी पर ईमेल करें

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