कंपालाइन - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

कंपालाइन - दो एकाधिक संरेखण की तुलना करें

SYNOPSIS

संकलित करना [-विकल्प]

वर्णन

संकलित करना विश्वसनीय संरेखण और परीक्षण के बीच आंशिक "पहचान" की गणना करता है
संरेखण। दोनों फ़ाइलों में बिल्कुल समान क्रम होना चाहिए, बिलकुल एक जैसा
आदेश.

एकाधिक अनुक्रम संरेखण की पहचान को औसत पहचान के रूप में परिभाषित किया गया है
सभी N(N-1)/2 जोड़ीवार संरेखण।

जोड़ीवार संरेखण के दो सेटों की भिन्नात्मक पहचान को निम्नानुसार परिभाषित किया गया है
(संरेखित ज्ञात अनुक्रम k1 और k2, और संरेखित परीक्षण अनुक्रम t1 और t2 के लिए):

मिलान किए गए कॉलम / कुल कॉलम

जहाँ कुल स्तंभ = कुल स्तंभों की संख्या
k1 या k2 में एक वैध (नॉनगैप) प्रतीक;

मिलान किए गए कॉलम = कॉलम की संख्या जिसमें से एक
निम्नलिखित सत्य है:

k1 और k2 दोनों के पास दिए गए कॉलम में वैध प्रतीक हैं; टी1 और टी2
t1/t2 के एक कॉलम में समान प्रतीक संरेखित हैं
संरेखण;

k1 में k2 के अंतराल से संरेखित एक प्रतीक है; t1 में वह प्रतीक है
एक अंतराल से भी जुड़ा हुआ;

k2 में k1 के अंतराल से संरेखित एक प्रतीक है; t2 में वह प्रतीक है
एक अंतराल के साथ भी संरेखित।

चूँकि सभी संभावित जोड़ियों के लिए अंकों की गणना की जाती है, एल्गोरिथ्म क्रम (N^2)L का है
लंबाई एल के एन अनुक्रम; बड़े अनुक्रम सेट में कुछ समय लगेगा।

विकल्प

उपलब्ध विकल्प:

-h संक्षिप्त सहायता और उपयोग की जानकारी प्रिंट करें।

-c केवल चिह्नित #=सीएस सर्वसम्मति संरचना के तहत तुलना करें।

--सूचना
निर्दिष्ट करें कि दोनों संरेखण प्रारूप में हैं (उदाहरण के लिए एमएसएफ)।

--शांत
वर्बोज़ हेडर को दबाएं (प्रतिगमन परीक्षण में प्रयुक्त)।

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