डीसीएमस्टैक - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

dcmstack - DICOM से NIfTI कनवर्टर

वर्णन

उपयोग: dcmstack [-h] [--फोर्स-रीड] [--फ़ाइल-ext FILE_EXT] [--allow-डमीज़]

[--dest-dir DEST_DIR] [-o OUTPUT_NAME] [--आउटपुट-एक्सटी OUTPUT_EXT] [-d]
[--एम्बेड-मेटा] [-g GROUP_BY] [--वोक्सल-ऑर्डर VOXEL_ORDER] [-t TIME_VAR]
[--वेक्टर-वर VECTOR_VAR] [--समय-आदेश TIME_ORDER] [--वेक्टर-आदेश VECTOR_ORDER]
[-एल] [--अक्षम-अनुवादक DISABLE_TRANSLATOR] [--निकालें-निजी] [-i
INCLUDE_REGEX] [-e EXCLUDE_REGEX] [--default-regexes] [-v] [--strict] [--version]
[src_dirs [src_dirs...]]

वैकल्पिक रूप से निकालते हुए, प्रत्येक स्रोत निर्देशिका से DICOM फ़ाइलों को 2D से 5D वॉल्यूम में स्टैक करें
मेटा डेटा।

अवस्था का तर्क:
src_dirs
स्रोत निर्देशिकाएँ जिनमें DICOM फ़ाइलें हैं।

वैकल्पिक तर्क:
-h, --मदद
यह सहायता संदेश दिखाएं और बाहर निकलें

निवेश विकल्प हैं:
--बलपूर्वक पढ़ें
सभी फ़ाइलों को DICOM के रूप में पढ़ने का प्रयास करें, भले ही उनमें प्रस्तावना न हो।

--फ़ाइल-ext FILE_EXT
केवल दिए गए एक्सटेंशन वाली फ़ाइलें पढ़ने का प्रयास करें। डिफ़ॉल्ट: .dcm

--अनुमति दें-डमी
आउटपुट के उस टुकड़े को भरने वाली DICOM फ़ाइलों को अनुमति दें जिनमें पिक्सेल डेटा गायब है
अधिकतम प्रतिनिधित्व योग्य मूल्य के साथ निफ्टी।

उत्पादन विकल्प हैं:
--dest-dir DEST_DIR
गंतव्य निर्देशिका, डिफ़ॉल्ट स्रोत निर्देशिका।

-o OUTPUT_NAME, --आउटपुट-नाम OUTPUT_NAME
DICOM टैग के आधार पर आउटपुट फ़ाइल नाम निर्धारित करने वाली पायथन प्रारूप स्ट्रिंग।

--आउटपुट-एक्सट OUTPUT_EXT
आउटपुट फ़ाइल प्रकार के लिए एक्सटेंशन. डिफ़ॉल्ट: .nii.gz

-d, --डंप-मेटा
निकाले गए मेटा डेटा को उसी आधार नाम के साथ JSON फ़ाइल में डंप करें
निफ़्टी उत्पन्न की

--एम्बेड-मेटा
निकाले गए मेटा डेटा को निफ्टी हेडर एक्सटेंशन (JSON प्रारूप में) में एम्बेड करें।

स्टैकिंग विकल्प:
-g द्वारा समूह बनाएं, --द्वारा समूह बनाएं द्वारा समूह बनाएं
इनपुट फ़ाइलों को स्टैक में समूहित करने के लिए मेटा डेटा कुंजियों की अल्पविराम से अलग की गई सूची।

--voxel-आदेश VOXEL_ORDER
स्वरों को क्रमित करें ताकि रोगी में स्थानिक सूचकांक इन दिशाओं से शुरू हों
अंतरिक्ष। रोगी स्थान में दिशा-निर्देश तीन अक्षर वाले कोड के रूप में दिए जाने चाहिए:
(एल)बाएं, (आर)आठ, (ए)पूर्वकाल, (पी)पश्च भाग, (एस)ऊपरी, (आई)निचला। खाली गुजरना
स्ट्रिंग पुनर्अभिविन्यास को अक्षम कर देगी। डिफ़ॉल्ट: एलएएस

-t TIME_VAR, --समय-वर TIME_VAR
समय आयाम के साथ स्टैक को ऑर्डर करने के लिए उपयोग किया जाने वाला DICOM तत्व कीवर्ड।

--वेक्टर-var VECTOR_VAR
वेक्टर आयाम के साथ स्टैक को ऑर्डर करने के लिए उपयोग किया जाने वाला DICOM तत्व कीवर्ड।

--समय का आदेश समय का आदेश
के मानों (प्रति पंक्ति एक) के लिए वांछित क्रम के साथ एक टेक्स्ट फ़ाइल प्रदान करें
समय चर के रूप में उपयोग की जाने वाली विशेषता। इस विकल्प की शायद ही कभी आवश्यकता पड़ती है.

--वेक्टर-आदेश वेक्टर_ऑर्डर
के मानों (प्रति पंक्ति एक) के लिए वांछित क्रम के साथ एक टेक्स्ट फ़ाइल प्रदान करें
वेक्टर वैरिएबल के रूप में उपयोग की जाने वाली विशेषता। इस विकल्प की शायद ही कभी आवश्यकता पड़ती है.

मेटा निष्कर्षण और छनन विकल्प:
-l, --सूची-अनुवादक
सक्षम अनुवादकों की सूची बनाएं और बाहर निकलें

--अक्षम-अनुवादक अक्षम_अनुवादक
दिए गए टैग के लिए अनुवादकों को अक्षम करें। टैग प्रारूप में दिए जाने चाहिए
"0x0_0x0"। अल्पविराम से अलग की गई सूची में एक से अधिक दिए जा सकते हैं। यदि शब्द "सभी"
प्रदान किया गया है, सभी अनुवादक अक्षम कर दिए जाएंगे।

--निकालें-निजी
निजी तत्वों से मेटा डेटा निकालें, भले ही कोई अनुवादक न हो। यदि
तत्व के मान में गैर-एएससीआईआई बाइट्स हैं, फिर भी इसे नजरअंदाज कर दिया जाएगा।
निकाले गए मेटा डेटा को अभी भी रेगुलर एक्सप्रेशन द्वारा फ़िल्टर किया जा सकता है।

-i INCLUDE_REGEX, --शामिल-रेगेक्स INCLUDE_REGEX
कोई भी मेटा डेटा शामिल करें जहां कुंजी प्रदान की गई नियमित अभिव्यक्ति से मेल खाती हो। यह
किसी भी बहिष्कृत अभिव्यक्ति को ओवरराइड कर देगा। सभी मेटा डेटा पर लागू होता है.

-e EXCLUDE_REGEX, --बहिष्कृत-रेगेक्स EXCLUDE_REGEX
किसी भी मेटा डेटा को बाहर करें जहां कुंजी प्रदान की गई नियमित अभिव्यक्ति से मेल खाती है। यह
डिफ़ॉल्ट बहिष्कृत अभिव्यक्तियों को पूरक करेगा। सभी मेटा डेटा पर लागू होता है.

--डिफ़ॉल्ट-regexes
डिफ़ॉल्ट की सूची को प्रिंट करें और नियमित अभिव्यक्तियों को बाहर निकालें और बाहर निकलें।

सामान्य जानकारी विकल्प:
-v, --शब्दशः
अतिरिक्त जानकारी प्रिंट करें।

--कठोर
चेतावनी दिखाने के बजाय पहले अपवाद पर विफल रहें।

--संस्करण
संस्करण दिखाएं और बाहर निकलें।

यह जानना आपकी ज़िम्मेदारी है कि मेटाडेटा में निजी स्वास्थ्य जानकारी है या नहीं
इस कार्यक्रम द्वारा निकाला गया.

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