यह कमांड डिमक्स है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर में से एक का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
demux - XPLOR दूरी प्रतिबंधों को Gromacs प्रारूप में बदलें
SYNOPSIS
demux के एमडी0.लॉग अतिरिक्त
वर्णन
यदि आप अपने प्रक्षेप पथ को फिर से निरंतर बनाना चाहते हैं तो आप इसका उपयोग कर सकते हैं demux के पढ़ने के लिए
आपकी md0.log फ़ाइल (यदि आवश्यक हो तो आप कई को जोड़ सकते हैं) और कुछ आउटपुट उत्पन्न करें
फ़ाइलें। इनमें से एक .xvg फ़ाइल है (प्रतिकृति_एनडीएक्स.एक्सवीजी) जिसे पारित किया जा सकता है trjcat(1) साथ में
मूल प्रक्षेपवक्र फ़ाइलों के साथ, निरंतर प्रक्षेपवक्र का उत्पादन करने के लिए। अन्य
फ़ाइल (प्रतिकृति_टेम्प.xvg) में प्रत्येक प्रतिकृति के लिए तापमान होता है, जो से शुरू होता है
मूल तापमान। इसलिए यदि आपकी रुचि की प्रतिकृति 300 K से शुरू होती है, तो आप अनुसरण कर सकते हैं
तापमान अंतरिक्ष के माध्यम से अपने प्रक्षेपवक्र। कुछ जोड़ना दिलचस्प होगा
प्रत्येक प्रतिकृति के लिए तापमान वितरण के हिस्टोग्राम बनाने की कार्यक्षमता, जो
अधिकांश लेखकों के अनुसार फ्लैट होना चाहिए। demuxed trajectories के साथ प्रयोग किया जा सकता है
जी_कैनेटीक्स(1) आरईएमडी प्रक्षेपवक्र से प्रोटीन तह कैनेटीक्स प्राप्त करने के लिए।
विकल्प
एमडी0.लॉग उस प्रक्षेपवक्र की लॉग फ़ाइल जिसे आप निरंतर बनाना चाहते हैं। एकाधिक फ़ाइलें हो सकती हैं
एक साथ जोड़ा।
अतिरिक्त लॉग फ़ाइल में प्रत्येक प्रविष्टि की कितनी बार प्रतिलिपि बनाई जाएगी। (पूर्णांक)
सीमाएं
यदि आपका एक्सचेंज हर एन पीएस था और आपने हर एम पीएस को बचाया जो आप लापता के लिए कर सकते हैं
सेटिंग द्वारा फ्रेम अतिरिक्त से (एन/एम -1)। यदि N/M पूर्णांक नहीं है, तो आप भाग्य से बाहर हैं और आप
आपके प्रक्षेप पथ को बिल्कुल भी निष्क्रिय नहीं कर पाएगा।
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन डेमोक्स का उपयोग करें
