डोमेनरेप - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

डोमेनरेप - प्रतिनिधि संरचनाओं की पहचान करने के लिए डीसीएफ फ़ाइल को पुन: व्यवस्थित करें।

SYNOPSIS

डोमेन प्रतिनिधि -dcfinfile फाइल में -नोड सूची -dcfoutfile आउटफाइल

डोमेन प्रतिनिधि -मदद

वर्णन

डोमेन प्रतिनिधि EMBOSS से एक कमांड लाइन प्रोग्राम है ("यूरोपीय आणविक जीवविज्ञान ओपन
सॉफ्टवेयर सूट")। यह "प्रोटीन: 3डी संरचना" कमांड समूह (समूहों) का हिस्सा है।

विकल्प

निवेश अनुभाग
-dcfinfile फाइल में
यह विकल्प DCF फ़ाइल (डोमेन वर्गीकरण फ़ाइल) (इनपुट) का नाम निर्दिष्ट करता है। ए
'डोमेन वर्गीकरण फ़ाइल' में डोमेन के लिए वर्गीकरण और अन्य डेटा शामिल है
एससीओपी या सीएटीएच, डीसीएफ प्रारूप (ईएमबीएल-जैसे) में। SCOPPARSE . का उपयोग करके फ़ाइलें उत्पन्न की जाती हैं
और कैथपर्स। डोमेन अनुक्रम जानकारी का उपयोग करके फ़ाइल में जोड़ा जा सकता है
डोमेनसेक.

अपेक्षित अनुभाग
-नोड सूची
यह विकल्प फ़ाइल को पुनः व्यवस्थित करने के लिए नोड को निर्दिष्ट करता है। के लिए पुनः व्यवस्थित किया जा सकता है
SCOP या CATH पदानुक्रम में कोई निर्दिष्ट नोड। उदाहरण के लिए 'क्लास' का चयन करके
एक ही कक्षा से संबंधित प्रविष्टियों को बारी-बारी से पुन: व्यवस्थित किया जाएगा। डिफ़ॉल्ट मान: 1

उत्पादन अनुभाग
-dcfoutfile आउटफाइल
यह विकल्प DCF फ़ाइल (डोमेन वर्गीकरण फ़ाइल) (आउटपुट) का नाम निर्दिष्ट करता है। ए
'डोमेन वर्गीकरण फ़ाइल' में डोमेन के लिए वर्गीकरण और अन्य डेटा शामिल है
एससीओपी या सीएटीएच, डीसीएफ प्रारूप (ईएमबीएल-जैसे) में। SCOPPARSE . का उपयोग करके फ़ाइलें उत्पन्न की जाती हैं
और कैथपर्स। डोमेन अनुक्रम जानकारी का उपयोग करके फ़ाइल में जोड़ा जा सकता है
डोमेनसेक. डिफ़ॉल्ट मान: test.scope

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