यह कमांड fastaq-to_tiling_bam है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
fastaq_to_tiling_bam - पूरे इनपुट में समान रूप से फैली हुई रीड्स की एक BAM फ़ाइल बनाएं
संदर्भ
वर्णन
उपयोग: fastaq_to_tiling_bam [विकल्प]
एक अनुक्रम फ़ाइल लेता है. एक BAM फ़ाइल बनाता है जिसमें सही (अयुग्मित) टाइलिंग रीडिंग होती है
संपूर्ण जीनोम
अवस्था का तर्क:
इनफ़ाइल इनपुट fasta/q फ़ाइल का नाम
read_length
पढ़ने की लंबाई
read_step
प्रत्येक पाठ की शुरुआत के बीच की दूरी
read_prefix
पढ़े गए नामों का उपसर्ग
आउटफाइल
आउटपुट BAM फ़ाइल का नाम
वैकल्पिक तर्क:
-h, --मदद
यह सहायता संदेश दिखाएं और बाहर निकलें
--क्वाल_चार QUAL_CHAR
गुणवत्ता स्कोर के लिए उपयोग किया जाने वाला चरित्र [I]
--पढ़ें_समूह पढ़ें_समूह
दी गई पठन समूह आईडी को सभी पठन में जोड़ें [42]
महत्वपूर्ण: मान लिया गया है कि samtools आपके रास्ते में है
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके fastaq-to_tiling_bam का ऑनलाइन उपयोग करें
