यह कमांड gt-eval है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर में से एक का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
gt-eval - एनोटेशन फ़ाइलों की तुलना करें और सटीकता के उपाय (भविष्यवाणी बनाम संदर्भ) दिखाएं।
SYNOPSIS
gt विकसित करना संदर्भ_फ़ाइल पूर्वानुमान_फ़ाइल
वर्णन
-नुकू [हाँ|नहीं]
न्यूक्लियोटाइड स्तर का मूल्यांकन करें (स्मृति खपत इनपुट फ़ाइल आकार के समानुपाती है)
(डिफ़ॉल्ट: हाँ)
-एल टीआर [हाँ|नहीं]
एक जीन भविष्यवाणी के बजाय एक एलटीआर रेट्रोट्रांसपॉसन भविष्यवाणी का मूल्यांकन करें (सभी
LTR_retrotransposon तत्वों को एक अनिर्धारित स्ट्रैंड माना जाता है) (डिफ़ॉल्ट:
ना)
-लटरडेल्टा [मूल्य]
एलटीआर सीमाओं के लिए अनुमत डेल्टा सेट को समान माना जाना चाहिए (डिफ़ॉल्ट: 20)
-v [हाँ|नहीं]
वर्बोज़ बनें (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
-o [फ़ाइल का नाम]
आउटपुट को निर्दिष्ट फ़ाइल पर रीडायरेक्ट करें (डिफ़ॉल्ट: अपरिभाषित)
-गज़िप [हाँ|नहीं]
gzip संपीड़ित आउटपुट फ़ाइल लिखें (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
-बज़िप2 [हाँ|नहीं]
bzip2 संपीड़ित आउटपुट फ़ाइल लिखें (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
फोर्स [हाँ|नहीं]
आउटपुट फ़ाइल को लिखने के लिए बाध्य करें (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
-मदद
सहायता प्रदर्शित करें और बाहर निकलें
-संस्करण
संस्करण की जानकारी प्रदर्शित करें और बाहर निकलें
कार्यक्रम कुछ विशेषता प्रकारों के लिए संवेदनशीलता और विशिष्टता मान दिखाता है (उदाहरण के लिए,
जीन, एमआरएनए और एक्सॉन)। कुछ फ़ीचर प्रकारों के लिए की गुम और गलत सुविधाओं की संख्या
प्रकार भी दिखाया गया है। इस प्रकार, "अनुपलब्ध" का अर्थ उस प्रकार की सुविधाओं की संख्या से है
"भविष्यवाणी" से उस प्रकार की एक विशेषता को ओवरलैप किए बिना "संदर्भ"। उपाध्यक्ष
इसके विपरीत, "गलत" बिना "भविष्यवाणी" से उस प्रकार की सुविधाओं की संख्या को दर्शाता है
"संदर्भ" से उस प्रकार की एक विशेषता को ओवरलैप करें।
रिपोर्टिंग बग
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