рдпрд╣ рдХрдорд╛рдВрдб gt-seqstat рд╣реИ рдЬрд┐рд╕реЗ рд╣рдорд╛рд░реЗ рдХрдИ рдореБрдлреНрдд рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди рдЬреИрд╕реЗ рдХрд┐ рдЙрдмрдВрдЯреВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рдлреЗрдбреЛрд░рд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдпрд╛ рдореИрдХ рдУрдПрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдлреНрд░реА рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдореЗрдВ рдЪрд▓рд╛рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред
рдХрд╛рд░реНрдпрдХреНрд░рдо:
рдирд╛рдо
gt-seqstat - рдлрд╛рд╕реНрдЯрд╛ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓(рдлрд╝рд╛рдЗрд▓реЛрдВ) рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЖрдБрдХрдбрд╝реЛрдВ рдХреА рдЧрдгрдирд╛ рдХрд░реЗрдВред
SYNOPSIS
gt seqstat [рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк] рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ [...]
рд╡рд░реНрдгрди
-v [рд╣рд╛рдБ|рдирд╣реАрдВ]
рд╡рд░реНрдмреЛрдЬрд╝ рдмрдиреЗрдВ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: рдирд╣реАрдВ)
-рдбрд┐рд╕реНрдЯрд▓реЗрди [рд╣рд╛рдБ|рдирд╣реАрдВ]
рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рд▓рдВрдмрд╛рдИ рдХрд╛ рд╡рд┐рддрд░рдг рджрд┐рдЦрд╛рдПрдВ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: рдирд╣реАрдВ)
-b [рдореВрд▓реНрдп]
рдбрд┐рд╕реНрдЯрд▓реЗрди рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдмрд╛рд▓реНрдЯреА рдХрд╛ рдЖрдХрд╛рд░ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: 100)
-рдмрд╛рдЗрдирд░реА [рд╣рд╛рдБ|рдирд╣реАрдВ]
рдбрд┐рд╕реНрдЯрд▓реЗрди рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд╛рдо рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдмрд╛рдЗрдирд░реА рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВ: .рдбрд┐рд╕реНрдЯрд▓реЗрди
рдмрд╛рд▓реНрдЯреА рдЖрдХрд╛рд░: 1 (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: рдирд╣реАрдВ)
-contigs [рд╣рд╛рдБ|рдирд╣реАрдВ]
рдХреЙрдиреНрдЯрд┐рдЧреНрд╕ рд╕реЗрдЯ рдЖрдБрдХрдбрд╝реЛрдВ рдХрд╛ рд╕рд╛рд░рд╛рдВрд╢ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: рд╣рд╛рдБ)
-рдЦрд┐рдВрдЪрд╛рд╡ [рд╣рд╛рдБ|рдирд╣реАрдВ]
рдП-рд╕рдмрд╕реНрдЯреНрд░рд┐рдВрдЧреНрд╕ рдХрд╛ рд╡рд┐рддрд░рдг рджрд┐рдЦрд╛рдПрдВ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: рдирд╣реАрдВ)
-рдЬреАрдиреЛрдо [рдореВрд▓реНрдп]
NG50/NG80 рдЧрдгрдирд╛ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЬреАрдиреЛрдо рд▓рдВрдмрд╛рдИ рд╕реЗрдЯ рдХрд░реЗрдВ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: 0)
-рдорджрдж
рдмреБрдирд┐рдпрд╛рджреА рд╡рд┐рдХрд▓реНрдкреЛрдВ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╕рд╣рд╛рдпрддрд╛ рдкреНрд░рджрд░реНрд╢рд┐рдд рдХрд░реЗрдВ рдФрд░ рдмрд╛рд╣рд░ рдирд┐рдХрд▓реЗрдВ
-рд╕рд╣рд╛рдпрддрд╛+
рд╕рднреА рд╡рд┐рдХрд▓реНрдкреЛрдВ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╕рд╣рд╛рдпрддрд╛ рдкреНрд░рджрд░реНрд╢рд┐рдд рдХрд░реЗрдВ рдФрд░ рдмрд╛рд╣рд░ рдирд┐рдХрд▓реЗрдВ
-рд╕рдВрд╕реНрдХрд░рдг
рд╕рдВрд╕реНрдХрд░рдг рдХреА рдЬрд╛рдирдХрд╛рд░реА рдкреНрд░рджрд░реНрд╢рд┐рдд рдХрд░реЗрдВ рдФрд░ рдмрд╛рд╣рд░ рдирд┐рдХрд▓реЗрдВ
рд░рд┐рдкреЛрд░реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдмрдЧ
рдмрдЧ рдХреА рд░рд┐рдкреЛрд░реНрдЯ рдХрд░реЗрдВ[рдИрдореЗрд▓ рд╕рдВрд░рдХреНрд╖рд┐рдд]>.
onworks.net рд╕реЗрд╡рд╛рдУрдВ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди gt-seqstat рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВ