यह कमांड लोड_जेनबैंकपी है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
Load_genbank.pl - जेनबैंक फ़ाइलों से Bio::DB::GFF डेटाबेस लोड करें।
SYNOPSIS
% लोड_जेनबैंक.पीएल -डी जेनबैंक -एफ लोकलफाइल.जीबी
% load_genbank.pl -d जेनबैंक -a AP003256
नोट: बायोपर्ल वितरण में स्क्रिप्ट bp_genbank2gff.pl इस स्क्रिप्ट के समान है।
वर्णन
यह स्क्रिप्ट किसी स्थानीय में निहित सुविधाओं के साथ एक Bio::DB::GFF डेटाबेस लोड करती है
जेनबैंक फ़ाइल या एक परिग्रहण जो जेनबैंक से प्राप्त किया गया है। विभिन्न कमांड-लाइन विकल्प
आपको यह नियंत्रित करने की अनुमति देता है कि किस डेटाबेस को लोड करना है और क्या मौजूदा डेटाबेस को अनुमति देनी है
अधिलेखित होना।
यह स्क्रिप्ट वर्तमान में केवल MySQL का उपयोग करती है, हालाँकि यह एक प्रमाण-सिद्धांत है और आसानी से किया जा सकता है
इसे अन्य आरडीएमएस के साथ काम करने के लिए बढ़ाया जा सकता है जो एडेप्टर के माध्यम से जीएफएफ द्वारा समर्थित हैं।
कमांड लाइन विकल्प
कमांड-लाइन विकल्पों को एकल-अक्षर विकल्पों में संक्षिप्त किया जा सकता है। उदाहरण के बजाय -d
--डेटाबेस।
--डेटाबेस का बल निर्माण और आरंभीकरण
--डीएसएन डेटा स्रोत (डिफ़ॉल्ट डीबीआई: MySQL: परीक्षण)
--उपयोगकर्ता mysql प्रमाणीकरण के लिए उपयोगकर्ता नाम
--उत्तीर्ण mysql प्रमाणीकरण के लिए पासवर्ड
--प्रॉक्सी रिमोट एक्सेस के लिए प्रॉक्सी सर्वर का उपयोग करें
--फ़ाइल तर्क जो अनुसरण करते हैं वे जेनबैंक/ईएमबीएल फ़ाइल नाम हैं (डिफ़ॉल्ट)
--एक्सेसन तर्क जो अनुसरण करते हैं वे जेनबैंक एक्सेसेशन नंबर हैं
--stdout लोड करने के बजाय परिवर्तित GFF फ़ाइल को stdout में लिखें
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन Load_genbankp का उपयोग करें
