यह कमांड माइक्रो_रेजर्स है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
माइक्रो_रेजर्स
SYNOPSIS
माइक्रो_रेजर्स [विकल्प]
वर्णन
माइक्रोरेजरएस संभवतः छोटे आरएनए रीड्स को मैप करने के लिए एक उपसर्ग-आधारित मैपिंग रणनीति का उपयोग करता है
जिसमें 3' एडाप्टर अनुक्रम शामिल है।
(सी) कॉपीराइट 2009 ऐनी-कैटरीन एम्डे द्वारा।
-h, --मदद
यह सहायता संदेश प्रदर्शित करता है।
--संस्करण
संस्करण जानकारी प्रदर्शित करें
मुख्य विकल्प::
-o, --आउटपुट फ़ाइल
आउटपुट फ़ाइल नाम बदलें. गलती करना: ।परिणाम।
-आरआर, --पहचान-दर NUM
प्रतिशत पहचान दर को [80..100] सीमा में सेट करें। डिफ़ॉल्ट: 100.
-एसएलई, --बीज-लंबाई NUM
बीज की लंबाई सीमा में [10..inf]। डिफ़ॉल्ट: 16.
-से, --बीज-त्रुटि
बीज में एक त्रुटि की अनुमति दें
-f, --आगे
मानचित्र केवल अग्रेषित स्ट्रैंड्स को पढ़ता है।
-r, --उलटना
मानचित्र केवल रिवर्स स्ट्रैंड्स को पढ़ता है।
-एमएन, --मैच-एन
'एन' अन्य सभी वर्णों से मेल खाता है
-m, --मैक्स-हिट NUM
रेंज में सर्वश्रेष्ठ हिट्स में से केवल NUM का आउटपुट [1..inf]। डिफ़ॉल्ट: 100.
-पा, --शुद्ध-अस्पष्ट
पर्ज मैक्स-हिट से अधिक सर्वोत्तम मिलानों के साथ पढ़ता है
-एलएम, --कम स्मृति
रनटाइम की कीमत पर मेमोरी उपयोग कम करें
-v, --शब्दशः
वाचाल प्रकार
-वीवी, --vverbose
बहुत वाचाल विधा
आउटपुट स्वरूप विकल्प::
-का, --आउटपुट स्वरूप NUM
आउटपुट स्वरूप सेट करें. 0 = माइक्रोरेज़रएस प्रारूप, 1 = एसएएम। रेंज में [0..1]।
-a, --संरेखण
प्रत्येक मैच के लिए संरेखण डंप करें
-जीएन, --जीनोम-नामकरण NUM
चुनें कि जीनोम का नाम कैसे रखा जाता है। 0 = फास्टा आईडी का उपयोग करें, 1 = 1 से शुरू करके गणना करें
रेंज [0..1]। डिफ़ॉल्ट: 0.
-आरएन, --पढ़ें-नामकरण NUM
चुनें कि रीड्स का नाम कैसे दिया जाता है। 0 = फास्टा आईडी का उपयोग करें, 1 = 1 से शुरू करके गणना करें
रेंज [0..1]। डिफ़ॉल्ट: 0.
-इसलिए, --क्रमबद्ध करेन का आदेश NUM
चुनें कि मिलानों को कैसे क्रमबद्ध किया जाता है. 0 = पढ़ी गई संख्या, 1 = जीनोम स्थिति। सीमा में
[0..1]. डिफ़ॉल्ट: 0.
-पीएफ, --स्थिति-प्रारूप NUM
प्रारंभ/अंत स्थिति क्रमांकन का चयन करें (नीचे समन्वय अनुभाग देखें)। 0 = गैप स्पेस,
1 = स्थिति स्थान. रेंज में [0..1]। डिफ़ॉल्ट: 0.
VERSION
माइक्रो_रेजर्स संस्करण: 1.0.1 अंतिम अद्यतन जुलाई 2009
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन माइक्रो_रेज़र्स का उपयोग करें
