यह कमांड यूजीन है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
यूजीन - एकीकृत जैव सूचना विज्ञान सुइट
SYNOPSIS
ugene -यूआई
ugene [विकल्प]
वर्णन
यूजीन डीएनए और प्रोटीन अनुक्रम विश्लेषण के लिए एक क्रॉस-प्लेटफ़ॉर्म वातावरण है। यूजीन
सबसे लोकप्रिय जैव सूचना विज्ञान कम्प्यूटेशनल एल्गोरिदम को एकीकृत करता है और जीयूआई दोनों प्रदान करता है
और जीनोमिक डेटा का जटिल विश्लेषण करने के लिए कमांड लाइन इंटरफ़ेस।
की मुख्य विशेषताएं यूजीन:
* एनोटेटेड डीएनए या प्रोटीन अनुक्रमों को देखें और उनका विश्लेषण करें
* क्रोमैटोग्राम विज़ुअलाइज़ेशन और संपादन
* पीडीबी और एमएमडीबी प्रारूपों में फ़ाइलों के लिए एकीकृत 3डी व्यूअर
* एनसीबीआई डेटाबेस के लिए खोज अनुरोधों का एकीकृत समर्थन
* MUSCLE3, MUSCLE4 और KAlign का उपयोग करके एकाधिक अनुक्रम संरेखण
* HMMER2 और HMMER3 के स्रोत के आधार पर HMM प्रोफाइल बनाएं और खोजें
* GORIV और PsiPred पर आधारित आधुनिक प्रोटीन माध्यमिक संरचना भविष्यवाणी एल्गोरिदम
* फ़िलिप के साथ फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण
* पीसीआर प्राइमर प्राइमर3 पैकेज का उपयोग करके डिज़ाइन किया गया है
* सिलिको में क्लोनिंग
* साइटकॉन का उपयोग करके डीएनए अनुक्रमों में प्रतिलेखन कारक बाइंडिंग साइटों की खोज करें
* प्रतिबंध एंजाइमों और REBASE के साथ एकीकरण की खोज करें
* प्रत्यक्ष और उलटा दोहराव खोजें
* बोटी का उपयोग करके डीएनए संदर्भ असेंबली
* प्रोटीन वापस अनुवाद
* ओआरएफ खोजें
* जटिल कम्प्यूटेशनल वर्कफ़्लो और प्रश्नों के लिए डिज़ाइनर
यूजीन इसकी संरचना मॉड्यूलर है और इसकी लगभग सभी कार्यक्षमताएँ प्लगइन्स के अंतर्गत आती हैं।
के भीतर यूजीन उपयोग से लाभ कमाने के लिए समानता के समर्थन से डिज़ाइन किया गया है
मल्टीकोर कंप्यूटर. प्रत्येक कम्प्यूटेशनल कार्य यूजीन पृष्ठभूमि में प्रदर्शन किया जाता है और करता है
ग्राफ़िकल इंटरफ़ेस के साथ उपयोगकर्ता के इंटरैक्शन को अवरुद्ध न करें।
विकल्प
-यूआई का GUI संस्करण चलाएँ यूजीन
--मदद सभी कमांड-लाइन विकल्पों और प्रोग्राम को संक्षेप में सारांशित करते हुए एक उपयोग संदेश प्रिंट करें
संस्करण, फिर बाहर निकलें।
--लाइसेंस
डंप लाइसेंस जानकारी
--कार्य= or स्कीमा-नाम> [स्कीमा-विकल्प]
दिए गए वर्कफ़्लो स्कीमा को चलाएँ
--स्थिति-बार-छिपाएँ
कार्य स्थिति पट्टी न दिखाएं
--ini-फ़ाइल=
कस्टम UGENE सेटिंग्स फ़ाइल लोड करें
--लॉग-नो-शो-स्तर
लॉग पर संदेश स्तर न दिखाएं
--लॉग-नो-शो-डेट
लॉग पर दिनांक और समय की जानकारी न दिखाएं
--लॉग-नो-शो-श्रेणी
लॉग पर संदेश श्रेणी न दिखाएं
--लॉग-स्तर-ट्रेस
ट्रेस लॉग संदेश दिखाएं
--लॉग-स्तर-कोई नहीं
लॉग संदेश न दिखाएँ
--लॉग-स्तर-जानकारी
त्रुटि और जानकारी लॉग संदेश दिखाएं (डिफ़ॉल्ट)
--लॉग-स्तर-त्रुटि
केवल त्रुटि लॉग संदेश दिखाएँ
--लॉग-स्तर-विवरण
विवरण लॉग संदेश दिखाएँ
--लॉग-रंग-आउटपुट
रंगीन आउटपुट संदेश
--टास्क-रिमोट-मशीन=
दिए गए कार्यों को दी गई रिमोट मशीन पर चलाएं
--यूजीन-जीवित रहो
दिए गए कार्यों को पूरा करने के बाद यूजीन को न रोकें
--अनुवाद=
निर्दिष्ट भाषा के अनुवाद लोड करें। भाषा को दो अक्षर वाले आईएसओ के रूप में निर्दिष्ट किया गया है
639 भाषा कोड
कमानों
यूजीन इसमें अधिकांश महत्वपूर्ण सुविधाओं के लिए कमांड हैं। कमांड को ऐसे चलाया जा सकता है
ugene [आदेश-तर्क]
ugene --कार्य= [आदेश-तर्क]
चल रहे प्रत्येक आदेश के लिए सहायता देखें ugene --मदद= .
उपलब्ध कमांड की सूची का उपयोग करके डंप किया जा सकता है ugene --मदद करना।
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके यूजीन का ऑनलाइन उपयोग करें
