यह कमांड वीसीएफ-सबसेट है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
वीसीएफ-सबसेट - वीसीएफ फ़ाइल का सबसेट बनाएं
SYNOPSIS
वीसीएफ-सबसेट [विकल्प] in.vcf.gz > आउट.वीसीएफ
विकल्प
-c, --स्तंभ
वीसीएफ फ़ाइल में रखने के लिए कॉलम की फ़ाइल या अल्पविराम से अलग की गई सूची। यदि फ़ाइल, एक
प्रति पंक्ति स्तंभ
-e, --बहिष्कृत-संदर्भ
उन पंक्तियों को बाहर निकालें जिनमें वैरिएंट नहीं हैं।
-p, --निजी
केवल उन पंक्तियों को प्रिंट करें जहां केवल सबसेट कॉलम में वैकल्पिक एलील होता है।
-r, --प्रतिस्थापन-साथ-रेफ
बहिष्कृत प्रकारों को डॉट के बजाय संदर्भ एलील से बदलें।
-t, --प्रकार
शामिल किए जाने वाले विभिन्न प्रकारों की अल्पविराम से अलग की गई सूची: एसएनपी, इंडेल्स।
-u, --रखें-अनचाहे
बिना कॉल वाली पंक्तियों को बाहर न करें.
-h, -?, --मदद
यह मदद संदेश।
उदाहरण
बिल्ली in.vcf | वीसीएफ-सबसेट -r -t indels -e -c नमूना1 > आउट.वीसीएफ
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन vcf-subset का उपयोग करें
