यह CStone नाम का Linux ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को cstone.zip के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
CStone नाम के इस ऐप को OnWorks के साथ मुफ्त में ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
स्क्रीनशॉट
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सीस्टोन
वर्णन
सीस्टोन आरएनए-सेक डेटा के लिए एक डे नोवो असेंबलर है जो ग्राफ़ की तरह डी ब्रुइज़न का उपयोग करता है और तीन ग्राफ़ वर्गीकरण स्तरों में से एक के साथ उत्पादित प्रत्येक कॉन्टिग को एनोटेट करता है जो दर्शाता है कि इसे गैर काइमेरिक होने की गारंटी दी जा सकती है या नहीं। वर्गीकरण का स्तर जीन परिवार की जटिलता पर निर्भर करता है जिससे रीड्स प्राप्त होते हैं। उप-उत्पाद के रूप में, यह अनुक्रमित किए गए अंतर्निहित जीन परिवारों की संरचनात्मक संरचना में अंतर्दृष्टि भी प्रदान करता है। अधिक विवरण शीघ्र ही हमारे पेपर में उपलब्ध होंगे: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
विशेषताएं
- RNA-Seq डेटा की नई असेंबली।
- गैर-काइमेरिक संक्रामकों की पहचान।
- क्रॉस-प्लेटफ़ॉर्म अनुकूलता.
- निष्पादन योग्य जार उपलब्ध है.
- किसी बाहरी पैकेज की आवश्यकता नहीं है.
- कोड का पालन करना आसान है और अन्य टूल में शामिल किया गया है।
- अंतर्निहित जीन परिवारों की जटिलता पर जानकारी।
- डी ब्रुइज़न को (अधिक उदार) दृष्टिकोण पसंद है।
यह एक एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/cstone/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। हमारे निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टमों में से एक से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है।
