यह ऑनलाइन Linux में चलने के लिए EXCAVATOR-tool नाम का Linux ऐप है, जिसकी नवीनतम रिलीज़ EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz के रूप में डाउनलोड की जा सकती है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
ऑनवर्क्स के साथ ऑनलाइन लिनक्स में चलने के लिए एक्सकेवेटर-टूल नाम के इस ऐप को ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
स्क्रीनशॉट
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EXCAVATOR-उपकरण Linux में ऑनलाइन चलाने के लिए
वर्णन
ध्यान!!!!!ध्यान !!!!!ध्यान !!!!!ध्यान !!!!!हमने हाल ही में BMC जीनोमिक्स पर एक नया सॉफ्टवेयर पैकेज प्रकाशित किया है, जिसका नाम XCAVATOR है, जो छोटे और लंबे समय तक पढ़े जाने वाले पूरे जीनोम अनुक्रमण प्रयोगों से CNV/CNA की पहचान के लिए है।https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
XCAVATOR मुक्त रूप से यहां उपलब्ध है http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
EXCAVATOR पूरे-एक्सोम सीक्वेंसिंग डेटा से कॉपी नंबर वेरिएंट (CNV) का पता लगाने के लिए एक नया सॉफ्टवेयर पैकेज है।
EXCAVATOR जीनोम बायोलॉजी पर प्रकाशित किया गया है (http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
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ध्यान!!!!! EXCAVATOR टूल का ठीक से उपयोग करने के लिए, उपयोगकर्ताओं को निम्न लिंक पर अद्वितीय मैपेबिलिटी फ़ाइलें डाउनलोड करनी होंगी:
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz (एचजी19 के लिए)
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
विशेषताएं
- अगली पीढ़ी अनुक्रमण
- कॉपी नंबर वेरिएंट
- संपूर्ण एक्सोम सीक्वेंसिंग
प्रोग्रामिंग भाषा
पर्ल
यह एक ऐसा एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/excavatortool/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है ताकि इसे हमारे एक फ्री ऑपरेटिव सिस्टम से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाया जा सके।