यह HSRA नाम का लिनक्स ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को HSRA-v1.1.tar.gz के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
एचएसआरए नाम के इस ऐप को ऑनवर्क्स के साथ मुफ्त में ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
एचएसआरए
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वर्णन
HSRA, RNA अनुक्रमण (RNA-seq) प्रयोगों से रीडिंग मैपिंग के लिए एक MapReduce-आधारित समानांतर उपकरण है। RNA-seq विश्लेषण आम तौर पर उस स्थान को निर्धारित करने के लिए एक संदर्भ जीनोम में रीडिंग मैपिंग से शुरू होता है जहां से रीड्स उत्पन्न हुए थे, जो एक बहुत समय लेने वाला कदम है। यह उपकरण जैव सूचना विज्ञान शोधकर्ताओं को अपाचे हडूप के साथ एक तेज मल्टीथ्रेडेड स्प्लिस्ड एलाइनर (एचआईएसएटी 2) के संयोजन से क्लस्टर के नोड्स पर अपने मैपिंग कार्यों को कुशलतापूर्वक वितरित करने की अनुमति देता है, जो स्केलेबल बिग डेटा प्रोसेसिंग के लिए एक वितरित कंप्यूटिंग ढांचा है।
HSRA वर्तमान में FASTQ/FASTA डेटासेट से सिंगल-एंड और पेयर-एंड रीड अलाइनमेंट का समर्थन करता है। इसके अलावा, हमारा टूल Hadoop डिस्ट्रिब्यूटेड फाइल सिस्टम (HDFS) पर संग्रहीत इनपुट डेटासेट को कुशलतापूर्वक पढ़ने के लिए Hadoop Sequence Parser (HSP) लाइब्रेरी (ऊपर लिंक) का उपयोग करता है, जो Gzip और BZip2 कोडेक्स के साथ संपीड़ित डेटासेट को संसाधित करने में सक्षम है।
दर्शक
सूचना प्रौद्योगिकी, स्वास्थ्य सेवा उद्योग, विज्ञान/अनुसंधान
यूजर इंटरफेस
कंसोल/टर्मिनल, कमांड-लाइन
प्रोग्रामिंग भाषा
जावा
श्रेणियाँ
यह एक ऐसा एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/hsra/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है ताकि इसे हमारे एक फ्री ऑपरेटिव सिस्टम से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाया जा सके।
