यह लिनक्स में ऑनलाइन चलने के लिए NGSEP नाम का लिनक्स ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ NGSEPcore_4.0.1.jar के रूप में डाउनलोड की जा सकती है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
एनजीएसईपी नाम के इस ऐप को ऑनवर्क्स के साथ ऑनलाइन लिनक्स में मुफ्त में चलाने के लिए डाउनलोड करें और ऑनलाइन चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
स्क्रीनशॉट
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एनजीएसईपी ऑनलाइन लिनक्स में चलेगा
वर्णन
एनजीएसईपी डीएनए उच्च थ्रूपुट अनुक्रमण डेटा के विश्लेषण के लिए एक एकीकृत ढांचा है। NGSEP का मुख्य उपयोग जीनोमिक भिन्नता के बड़े डेटासेट का निर्माण और डाउनस्ट्रीम विश्लेषण है। NGSEP सिंगल न्यूक्लियोटाइड वेरिएंट (एसएनवी), छोटे और बड़े इंडल्स, शॉर्ट टेंडेम रिपीट (एसटीआर), इनवर्जन और कॉपी नंबर वेरिएंट (सीएनवी) की सटीक पहचान और जीनोटाइपिंग करता है। एनजीएसईपी कार्यात्मक एनोटेशन, फ़िल्टरिंग, प्रारूप रूपांतरण, तुलना, क्लस्टरिंग, प्रतिरूपण, अंतर्मुखी विश्लेषण और विभिन्न प्रकार के आंकड़ों के लिए मॉड्यूल भी प्रदान करता है। कार्यात्मकताओं की एक पूरी सूची हमारे विकि में उपलब्ध है (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).समाचार: हमने अभी संस्करण 4 की पहली कमांड लाइन रिलीज उपलब्ध कराई है, जिसमें एफएम-इंडेक्स आधारित रीड एलाइनर का अपना कार्यान्वयन शामिल है। कमांड लाइन के उपयोग को पूरे एप्लिकेशन पर मानकीकृत किया गया था। कृपया इस नए संस्करण में अपग्रेड करने के लिए स्क्रिप्ट को अपडेट करने के लिए समय निकालें। अधिक विवरण विकि में उपलब्ध हैं।
विशेषताएं
- एसएनपी, सीएनवी और स्ट्रक्चरल वेरिएंट डिटेक्शन
- कच्चे का संरेखण एक संदर्भ जीनोम को पढ़ता है
- वीसीएफ हेरफेर: कार्यात्मक एनोटेशन, मर्ज, फ़िल्टर, तुलना, प्रारूप रूपांतरण, प्रतिरूपण
- सैम/बीएएम और वीसीएफ सांख्यिकी गणना और प्लॉटिंग
- डेमल्टीप्लेक्सिंग पढ़ता है
- एनोटेट जीनोम असेंबली का संरेखण
- GFF3 प्रारूप में प्रतिलेखीय व्याख्याओं पर सांख्यिकी और फ़िल्टरिंग
दर्शक
स्वास्थ्य सेवा उद्योग, विज्ञान/अनुसंधान, अन्य दर्शक, कृषि
यूजर इंटरफेस
जावा एसडब्ल्यूटी, कंसोल/टर्मिनल, ग्रहण
प्रोग्रामिंग भाषा
जावा
यह एक ऐसा एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/ngsep/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है ताकि इसे हमारे एक फ्री ऑपरेटिव सिस्टम से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाया जा सके।
