यह P3BSseq नाम का Linux ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को P3BSseq_v2.1.zip के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
P3BSseq नाम के इस ऐप को OnWorks के साथ मुफ्त में ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
स्क्रीनशॉट
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P3BSseq
वर्णन
Bisulfite अनुक्रमण (BSseq) प्रसंस्करण सबसे बोझिल अगली पीढ़ी अनुक्रमण (NGS) अनुप्रयोगों में से एक है। हालांकि कुछ बीएसएसईक्यू प्रसंस्करण उपकरण उपलब्ध हैं, वे बिखरे हुए हैं, अजीब पैरामीटर की आवश्यकता है और चल रहे समय और स्मृति-उपयोग की मांग कर रहे हैं। हमने P3BSseq विकसित किया है, BSseq के तेज, सटीक और स्वचालित विश्लेषण के लिए समानांतर प्रसंस्करण पाइपलाइन पढ़ता है कि ट्रिम, संरेखित, एनोटेट, मध्यवर्ती परिणामों को रिकॉर्ड करता है, बाइसल्फाइट रूपांतरण गुणवत्ता मूल्यांकन करता है, एनआईएच मानकों का पालन करते हुए बीईडी मिथाइलोम और रिपोर्ट फाइलें उत्पन्न करता है। P3BSseq रनिंग टाइम, कंप्यूटर हार्डवेयर आवश्यकताओं के संबंध में जाने-माने BSseq मैपर्स से बेहतर प्रदर्शन करता है। हमने P3BSseq मापदंडों को दिशात्मक और गैर-दिशात्मक दोनों पुस्तकालयों के लिए अनुकूलित किया है, और पूरे जीनोम और कम किए गए प्रतिनिधित्व BSseq के सिंगल-एंड और पेयर-एंड रीड्स दोनों के लिए। P3BSseq BSseq अपस्ट्रीम विश्लेषण के लिए एक उपयोगकर्ता के अनुकूल सुव्यवस्थित समाधान है, जिसके लिए केवल बुनियादी कंप्यूटर और NGS ज्ञान की आवश्यकता होती है।
विशेषताएं
- अगली पीढ़ी अनुक्रमण (एनजीएस) डेटा प्रोसेसिंग
- डीएनए मिथाइलोमिक्स विश्लेषण
- समानांतर प्रसंस्करण
- बाइसल्फाइट अनुक्रमण (आरआरबीएस) का कम प्रतिनिधित्व
दर्शक
विज्ञान/अनुसंधान
यूजर इंटरफेस
कंसोल/टर्मिनल
प्रोग्रामिंग भाषा
अजगर
श्रेणियाँ
यह एक ऐसा एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/p3bsseq/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है ताकि इसे हमारे एक फ्री ऑपरेटिव सिस्टम से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाया जा सके।
