यह PPSeq: Parallel NGS Analysis नाम का Linux ऐप है जो Linux में ऑनलाइन चलता है, जिसकी नवीनतम रिलीज़ ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz के रूप में डाउनलोड की जा सकती है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
PPSeq नाम के इस ऐप को ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं: समानांतर एनजीएस विश्लेषण ऑनवर्क्स के साथ ऑनलाइन लिनक्स में मुफ्त में चलाने के लिए।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
स्क्रीनशॉट
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PPSeq: ऑनलाइन Linux में चलने के लिए समानांतर NGS विश्लेषण
वर्णन
उच्च-थ्रूपुट अगली पीढ़ी की अनुक्रमण (एनजीएस) तकनीक जैव चिकित्सा अनुसंधान के कई पहलुओं में एक शक्तिशाली उपकरण के रूप में तेजी से उभरी है। हालांकि, इसके तेजी से विकास के साथ, एनजीएस के लिए डेटा परिमाण और विश्लेषण जटिलता पारंपरिक छोटे पैमाने की कंप्यूटिंग सुविधाओं की क्षमता और क्षमता से कहीं अधिक है, जैसे स्टैंडअलोन वर्कस्टेशन पर मल्टीथ्रेडिंग एल्गोरिदम। इस मुद्दे को हल करने के लिए, हम यहां बड़े पैमाने पर समानांतर प्रसंस्करण (एमपीपी) सिस्टम द्वारा प्रसंस्करण शक्ति की बढ़ती आपूर्ति का उपयोग करके एक समाधान प्रस्तुत करते हैं।विशेषताएं
- ppalgn - अनुक्रमण को संरेखित करना लंबे संदर्भ अनुक्रमों को पढ़ता है
- पीपीबीडब्ल्यूटी - डीएनए अनुक्रमों के एक सेट से एफएम-इंडेक्स का निर्माण
दर्शक
शिक्षा, इंजीनियरिंग, स्वास्थ्य उद्योग, सूचना प्रौद्योगिकी, गैर-लाभकारी संगठन, विज्ञान/अनुसंधान
यूजर इंटरफेस
कमांड लाइन
प्रोग्रामिंग भाषा
सी + +
यह एक ऐसा एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/ppseq/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है ताकि इसे हमारे एक फ्री ऑपरेटिव सिस्टम से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाया जा सके।
