यह Subread नाम का Linux ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
Subread with OnWorks नाम के इस ऐप को मुफ्त में ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
सबरीड
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वर्णन
Subread सॉफ़्टवेयर पैकेज अगली पीढ़ी के अनुक्रमण डेटा को संसाधित करने के लिए एक टूल किट है। इसमें सबब्रेड एलाइनर, सबजंक एक्सॉन-एक्सॉन जंक्शन डिटेक्टर और फीचरकाउंट्स रीड समराइजेशन प्रोग्राम शामिल हैं।
सबब्रेड एलाइनर का उपयोग जीडीएनए-सीक्यू और आरएनए-सीक्यू दोनों को संरेखित करने के लिए किया जा सकता है। Subjunc संरेखक को एक्सॉन-एक्सॉन जंक्शन का पता लगाने के लिए डिज़ाइन किया गया था। RNA-seq रीडिंग की मैपिंग के लिए, Subread स्थानीय संरेखण करता है और Subjunc वैश्विक संरेखण करता है। सब्रेड और सबजंक को निम्नलिखित पेपर में प्रकाशित किया गया था: यांग लियाओ, गॉर्डन के स्मिथ और वेई शि। "द सबब्रेड एलाइनर: सीड-एंड-वोट द्वारा तेज़, सटीक और स्केलेबल रीड मैपिंग", न्यूक्लिक एसिड रिसर्च, 2013, 41(10):e108
विशेषताएं
- संरेखण पढ़ें
- अगली पीढ़ी का अनुक्रमण
दर्शक
विज्ञान/अनुसंधान
यूजर इंटरफेस
कमांड लाइन
प्रोग्रामिंग भाषा
C
कैटिगरीज
यह एक ऐसा एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/subread/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है ताकि इसे हमारे एक फ्री ऑपरेटिव सिस्टम से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाया जा सके।
