यह लिनक्स ऐप है जिसका नाम SuRankCo है और इसे ऑनलाइन लिनक्स में चलाया जा सकता है, जिसका नवीनतम संस्करण surankco_r5.tar.gz के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता OnWorks में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
लिनक्स में OnWorks के साथ ऑनलाइन चलाने के लिए SuRankCo नामक इस ऐप को डाउनलोड करें और ऑनलाइन चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
SuRankCo लिनक्स ऑनलाइन में चलेगा
Ad
वर्णन
SuRankCo एक मशीन लर्निंग आधारित सॉफ्टवेयर है जो अगली पीढ़ी के अनुक्रमण डेटा की डी नोवो असेंबली से कंटिग्स को स्कोर और रैंक करता है। यह ज्ञात संदर्भ जीनोम के साथ कंटिग्स के संरेखण के साथ प्रशिक्षित करता है और उन कंटिग्स के लिए स्कोर और रैंकिंग की भविष्यवाणी करता है जिनका अभी तक कोई संबंधित संदर्भ जीनोम नहीं है।SuRankCo और इसकी कार्यप्रणाली के बारे में अधिक जानकारी के लिए कृपया देखें
"SuRankCo: डे नोवो असेंबलीज़ में कंटिग्स की पर्यवेक्षित रैंकिंग"
माथियास कुह्रिंग, पियोत्र वोजटेक डाब्रोव्स्की, एंड्रियास नित्शे और बर्नहार्ड वाई. रेनार्ड
(http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/240/abstract)
कृपया ध्यान दें, SuRankCo का उपयोग करने से पहले पेपर और readme.txt फ़ाइल को पढ़ने की सिफारिश की जाती है।
अद्यतन जून2015:
* BAM समर्थन को सक्षम करने के लिए मामूली परिवर्तन.
अद्यतन फरवरी 2014:
* ACE/FASTQ(QUAL) के अतिरिक्त FASTA/SAM असेंबली के लिए समर्थन जोड़ा गया।
नोट: FASTA/SAM असेंबली की विशेषताओं में अभी तक BaseCount, BaseSeqmentCount और ContigQualities शामिल नहीं हैं।
दर्शक
विज्ञान/अनुसंधान
यूजर इंटरफेस
कमांड लाइन
प्रोग्रामिंग भाषा
जावा, एस/आर
यह एक ऐसा एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/surankco/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। इसे हमारे किसी एक निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टम से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए OnWorks में होस्ट किया गया है।
