ViralFusionSeq [VFS] लिनक्स में चलाने के लिए L के लिए ऑनलाइन डाउनलोड करें

यह Linux में ऑनलाइन चलने के लिए ViralFusionSeq [VFS] नामक Linux ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को vfs-2016-08-17.r2.tar.gz के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।

स्क्रीनशॉट

ViralFusionSeq [VFS] लिनक्स में ऑनलाइन चलाने के लिए

वर्णन

वीएफएस का पूरी तरह से उबंटू/डेबियन प्रणाली के तहत परीक्षण किया गया था।

** घोषणा 1**: वीएफएस वायरस-क्लिप से बेहतर है। https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/files/VFS.vs.Virus-Clip.pdf/download

2016 तक, वीएफएस एनआईएच एचपीसी सिस्टम पर उपलब्ध एकमात्र वायरल एकीकरण उपकरण है।
https://hpc.nih.gov/apps/ViralFusionSeq/

ViralFusionSeq (VFS) वायरल एकीकरण घटनाओं की खोज करने और एकल-बेस रिज़ॉल्यूशन पर फ़्यूज़न ट्रांसक्रिप्ट को फिर से बनाने के लिए एक बहुमुखी उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण (HTS) उपकरण है।

वीएफएस वायरल-मानव संलयन घटनाओं की खोज और व्याख्या करने के लिए सॉफ्ट-क्लिपिंग जानकारी, रीड-पेयर विश्लेषण और लक्षित डे नोवो असेंबली को जोड़ती है।

फ़्यूज़न ब्रेकप्वाइंट की गुणवत्ता का मूल्यांकन करने के लिए एक सरल लेकिन प्रभावी अनुभवजन्य सांख्यिकीय मॉडल का उपयोग किया जाता है।

न्यूनतम उपयोगकर्ता परिभाषित पैरामीटर आवश्यक हैं।

उपयोगकर्ता मैनुअल और वीएफएस की स्थापना गाइड के साथ स्रोत कोड सोर्सफोर्ज के "फ़ाइलें" अनुभाग पर उपलब्ध है।

प्रशस्ति पत्र: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

विशेषताएं

• आरएनए-सेक और डीएनए-सेक डेटा का उपयोग करके लागू और पूरी तरह से परीक्षण किया गया
• वायरल एकीकरण की खोज के लिए क्लिप्ड-सीक्वेंस (सीएस) और पेयर-एंड (आरपी) दोनों जानकारी का उपयोग करें
• सीएस और आरपी जानकारी का उपयोग करके फ़्यूज़न ट्रांसक्रिप्ट अनुक्रम का पुन: निर्माण

दर्शक

विज्ञान/अनुसंधान

प्रोग्रामिंग भाषा

पर्ल

यह एक एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/viralfundseq/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। हमारे निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टमों में से एक से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है।