Ini adalah perintah bamtools yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
bamtools - toolkit untuk memanipulasi file BAM (penyelarasan genom)
RINGKASAN
alat bambu [--help] PERINTAH [ARGS]
DESKRIPSI
BamTools memfasilitasi analisis penelitian dan pengelolaan data menggunakan file BAM. Ini mengatasi
sejumlah besar data yang dihasilkan oleh teknologi pengurutan saat ini yang biasanya
disimpan dalam format biner terkompresi yang tidak mudah ditangani oleh pengurai berbasis teks
umum digunakan dalam penelitian bioinformatika.
PILIHAN
mengubah
Mengonversi antara BAM dan sejumlah format lainnya
count Mencetak jumlah penjajaran dalam file BAM
liputan
Mencetak statistik cakupan dari file BAM input
filter Filter file BAM menurut kriteria yang ditentukan pengguna
header Mencetak informasi header BAM
index Menghasilkan indeks untuk file BAM
menggabungkan Menggabungkan beberapa file BAM menjadi satu file
acak Pilih perataan acak dari file BAM yang ada, lebih dimaksudkan sebagai pengujian
tool.
menyelesaikan
Menyelesaikan pembacaan akhir berpasangan (menandai flag IsProperPair sesuai kebutuhan)
revert Menghapus tanda duplikat dan mengembalikan kualitas dasar asli
sort Mengurutkan file BAM menurut beberapa kriteria
split Membagi file BAM pada properti yang ditentukan pengguna, membuat file output BAM baru untuk
setiap nilai yang ditemukan
stats Mencetak beberapa statistik dasar dari file BAM input
Lihat 'bamtools help COMMAND' untuk informasi lebih lanjut tentang perintah tertentu.
Gunakan bamtools online menggunakan layanan onworks.net
