Ini adalah perintah bp_oligo_countp yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
bp_oligo_count - jumlah dan frekuensi oligo
RINGKASAN
Penggunaan: bp_oligo_count [-h/--help] [-l/--length OLIGOLENGTH]
[-f/--format SEQFORMAT] [-i/--in/-s/--urutan SEQFILE]
[-o/--outFILE]
DESKRIPSI
Skrip ini menghitung kemunculan dan frekuensi untuk semua oligonukleotida dengan panjang tertentu.
Ini dapat digunakan untuk menentukan primer apa yang berguna untuk priming asam nukleat yang sering
untuk pelabelan acak.
Perhatikan bahwa skrip ini dapat dijalankan dengan memanfaatkan program compseq yang merupakan bagian dari
MENATAH.
PILIHAN
Format urutan default adalah fasta. Jika tidak ada outfile yang diberikan, hasilnya akan dicetak
untuk standar keluar. Semua opsi lain dapat dimasukkan secara interaktif.
KOMENTAR
Mailing daftar
Umpan balik pengguna merupakan bagian integral dari evolusi modul ini dan modul Bioperl lainnya. Mengirim
komentar dan saran Anda sebaiknya ke milis Bioperl. Partisipasi Anda
sangat dihargai.
[email dilindungi] - Diskusi Umum
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Tentang milis
Pelaporan Bug
Laporkan bug ke sistem pelacakan bug Bioperl untuk membantu kami melacak bug dan mereka
resolusi. Laporan bug dapat dikirimkan melalui web:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
PENULIS - Charles C. Kim
Email [email dilindungi]
SEJARAH
Ditulis 2 Juli 2001
Dikirim ke proyek skrip bioperl 2001/08/06
>> 100x optimasi kecepatan oleh Heikki Lehvaslaiho
Gunakan bp_oligo_countp online menggunakan layanan onworks.net
