Ini adalah perintah bp_sreformatp yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
bpsreformat - konversi format urutan
DESKRIPSI
Skrip ini menggunakan sistem SeqIO yang memungkinkan konversi format urutan baik
urutan data atau beberapa urutan data keselarasan. Nama itu berasal dari fakta bahwa Sean
Format ulang program Eddy (bagian dari pkg HMMER) sudah melakukan ini. Program Sean mencoba
untuk menebak format input sementara dalam kode kami saat ini kami meminta Anda untuk menentukan apa yang
format input dan output adalah dan jika data berasal dari penyelarasan beberapa urutan atau dari
file urutan lurus.
Pemakaian:
bpsreformat -jika INFORMAT -dari OUTFORMAT -i FILENAME -o output.FORMAT
-h/--help Cetak bantuan ini
-if/--informat Tentukan format input
-of/--outformat Tentukan format output
-i/--input Tentukan nama file input
(untuk meneruskan data pada STDIN gunakan tanda minus sebagai nama file)
-o/--output Tentukan nama file output
(untuk melewatkan data di STDOUT gunakan tanda minus sebagai nama file)
--msa Tentukan ini adalah data penyelarasan beberapa urutan
--special Akan meneruskan parameter khusus ke AlignIO/SeqIO
objek -- sebagian besar untuk objek Bio::AlignIO
Daftar yang dipisahkan koma berikut ini
nointerleaved -- untuk phylip, format non-interleaved
idlinebreak -- untuk phylip, buat format molphy
persentase -- untuk kluster, tampilkan % id per baris
Gunakan bp_sreformatp online menggunakan layanan onworks.net
