Ini adalah perintah checktranse yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
checktrans - Melaporkan kodon STOP dan statistik ORF dari suatu protein
RINGKASAN
checktrans -urutan seqall -orfml bilangan bulat [-tambahkan terakhir boolean] -file keluar file keluar
-outseq seqoutall -mengalahkan prestasi
checktrans -bantu
DESKRIPSI
checktrans adalah program baris perintah dari EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paket Perangkat Lunak"). Ini adalah bagian dari perintah "Nukleat: Penemuan gen, Nukleat: Terjemahan"
kelompok.
PILIHAN
Memasukkan bagian
-urutan seqall
Wajib bagian
-orfml bilangan bulat
Nilai default: 100
Tambahan bagian
-tambahkan terakhir boolean
Tanda bintang dalam urutan protein menunjukkan posisi kodon STOP. Checktrans
mengasumsikan bahwa semua ORF berakhir dengan kodon STOP. Memaksa urutan untuk diakhiri dengan
asterisk, jika belum ada, buat checktrans perlakukan akhir sebagai
ORF potensial. Jika tanda bintang ditambahkan, itu tidak termasuk dalam hitungan yang dilaporkan
BERHENTI. Nilai default: Y
Keluaran bagian
-file keluar file keluar
-outseq seqoutall
File urutan untuk menampung urutan output ORF
-mengalahkan prestasi
File untuk fitur keluaran
Gunakan checktranse online menggunakan layanan onworks.net
