Ini adalah perintah DBdust yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
DBdust - deskripsi
RINGKASAN
debu DB [-b] [-wint(64)] [-tganda (2.)] [-mint(10)] jalur:db|dam
DESKRIPSI
Menjalankan algoritme DUST simetris pada pembacaan dalam DB yang tidak dipangkas path.db atau path.bendungan
memproduksi trek.path.dust[.anno,.data] yang menandai semua interval dengan kompleksitas rendah
urutan, di mana jendela pemindaian berukuran -w, ambang batas untuk kompleksitas rendah
intervalnya adalah -t, dan hanya interval ukuran sempurna yang lebih besar dari -m dicatat. jika
-b opsi diatur maka definisi kompleksitas rendah memperhitungkan frekuensi
basis yang diberikan. Perintahnya inkremental jika diberikan DB yang data barunya telah ditambahkan
karena terakhir dijalankan pada DB, maka itu akan memperluas trek untuk menyertakan bacaan baru.
Penting untuk menetapkan tanda ini untuk genom dengan bias AT/GC yang kuat, meskipun kodenya adalah
sedikit lebih lambat. Jejak debu, jika ada, dipahami dan digunakan oleh Pertunjukan DB(1)
Statistik DB(1), dan penggaris(1).
debu DB juga dapat dijalankan di atas blok DB yang belum dipotong dalam hal ini ia mengeluarkan trek
pengkodean di mana nama file jejak berisi nomor blok, misalnya .FOO.3.dust.anno dan
.FOO.3.dust.data, diberikan FOO.3 pada baris perintah. Kami menyebutnya sebagai blok jalur. Ini
memungkinkan paralelisme pekerjaan dalam potongan berukuran blok, dan urutan trek blok yang dihasilkan
kemudian dapat digabungkan menjadi trek untuk seluruh DB yang belum dipangkas dengan Catrack.
Gunakan DBdust online menggunakan layanan onworks.net
