dcmstack - Online di Cloud

PROGRAM:

NAMA

dcmstack - konverter DICOM ke NIfTI

DESKRIPSI

penggunaan: dcmstack [-h] [--force-read] [--file-ext FILE_EXT] [--allow-dummies]

[--tujuan-dir DEST_DIR] [-o OUTPUT_NAME] [--output-ext OUTPUT_EXT] [-d]
[--sematkan-meta] [-g GROUP_BY] [--pesanan voxel VOXEL_ORDER] [-t TIME_VAR]
[--vector-var VECTOR_VAR] [--urutan-waktu TIME_ORDER] [--urutan-vektor VECTOR_ORDER]
[-l] [--disable-translator DISABLE_TRANSLATOR] [--ekstrak-pribadi] [-i
INCLUDE_REGEX] [-e EXCLUDE_REGEX] [--default-regex] [-v] [--strict] [--version]
[src_dirs [src_dirs ...]]

Tumpuk file DICOM dari setiap direktori sumber ke dalam volume 2D hingga 5D, secara opsional mengekstrak
data-meta.

posisi argumen:
src_dirs
Direktori sumber yang berisi file DICOM.

opsional argumen:
-h, --membantu
tunjukkan pesan bantuan ini dan keluar

Memasukkan pilihan:
--force-baca
Coba baca semua file sebagai DICOM, meskipun tidak ada pembukaannya.

--file-ext FILE_EXT
Hanya coba baca file dengan ekstensi yang diberikan. Bawaan: .dcm

--allow-dummys
Izinkan file DICOM yang tidak memiliki data piksel, mengisi potongan output itu
nifti dengan nilai representable maksimum.

Keluaran pilihan:
--tujuan-dir TUJUAN_DIR
Direktori tujuan, default ke direktori sumber.

-o OUTPUT_NAME, --nama-keluaran OUTPUT_NAME
String format python menentukan nama file keluaran berdasarkan tag DICOM.

--keluaran-ext KELUARAN_EXT
Ekstensi untuk jenis file keluaran. Bawaan: .nii.gz

-d, --buang-meta
Buang meta data yang diekstrak ke dalam file JSON dengan nama dasar yang sama dengan
menghasilkan Nifti

--sematkan-meta
Sematkan data meta yang diekstraksi ke dalam ekstensi header Nifti (dalam format JSON).

Penumpukan Pilihan:
-g GROUP_BY, --grup-oleh GROUP_BY
Daftar kunci meta data yang dipisahkan koma untuk mengelompokkan file input ke dalam tumpukan.

--pesanan voxel VOXEL_ORDER
Pesan voxel sehingga indeks spasial dimulai dari arah ini pada pasien
ruang angkasa. Petunjuk di ruang pasien harus diberikan sebagai kode tiga karakter:
(l)belakang, (kanan)kanan, (a)nterior, (p)osterior, (s)superior, (i)inferior. Melewati yang kosong
string akan menonaktifkan reorientasi. Bawaan: LAS

-t WAKTU_VAR, --waktu-var WAKTU_VAR
Kata kunci elemen DICOM yang digunakan untuk mengurutkan tumpukan sepanjang dimensi waktu.

--vektor-var VEKTOR_VAR
Kata kunci elemen DICOM yang digunakan untuk mengurutkan tumpukan di sepanjang dimensi vektor.

--waktu-pesanan WAKTU_ORDER
Berikan file teks dengan urutan yang diinginkan untuk nilai (satu per baris) dari
atribut yang digunakan sebagai variabel waktu. Opsi ini jarang diperlukan.

--urutan vektor VECTOR_ORDER
Berikan file teks dengan urutan yang diinginkan untuk nilai (satu per baris) dari
atribut yang digunakan sebagai variabel vektor. Opsi ini jarang diperlukan.

meta Pencabutan dan Penyaringan Pilihan:
-l, --daftar-penerjemah
Daftar penerjemah yang diaktifkan dan keluar

--nonaktifkan-penerjemah DISABLE_TRANSLATOR
Nonaktifkan penerjemah untuk tag yang disediakan. Tag harus diberikan dalam format
"0x0_0x0". Lebih dari satu dapat diberikan dalam daftar yang dipisahkan koma. Jika kata "semua"
disediakan, semua penerjemah akan dinonaktifkan.

--ekstrak-pribadi
Ekstrak data meta dari elemen pribadi, meskipun tidak ada penerjemah. jika
nilai untuk elemen yang mengandung byte non-ascii itu akan tetap diabaikan. NS
data meta yang diekstraksi masih dapat disaring oleh ekspresi reguler.

-i TERMASUK_REGEX, --termasuk-regex TERMASUK_REGEX
Sertakan data meta apa pun yang kuncinya cocok dengan ekspresi reguler yang disediakan. Ini
akan menimpa ekspresi pengecualian apa pun. Berlaku untuk semua data meta.

-e KECUALI_REGEX, --kecuali-regex KECUALI_REGEX
Kecualikan meta data yang kuncinya cocok dengan ekspresi reguler yang disediakan. Ini
akan melengkapi ekspresi pengecualian default. Berlaku untuk semua data meta.

--default-regex
Cetak daftar default termasuk dan kecualikan ekspresi reguler dan keluar.

Umum Pilihan:
-v, --bertele-tele
Cetak informasi tambahan.

--ketat
Gagal pada pengecualian pertama alih-alih menampilkan peringatan.

--Versi: kapan
Tampilkan versi dan keluar.

TANGGUNG JAWAB ANDA UNTUK MENGETAHUI APAKAH ADA INFORMASI KESEHATAN PRIBADI DI METADATA
DIEKSTRAK OLEH PROGRAM INI.

Gunakan dcmstack online menggunakan layanan onworks.net