Ini adalah perintah fastaq-to_perfect_reads yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
fastaq_to_perfect_reads - Buat bacaan berpasangan yang sempurna dari referensi
DESKRIPSI
penggunaan: fastaq_to_perfect_reads [opsi]
penyimpangan>
Membuat pembacaan fastq akhir berpasangan sempurna dari file urutan, dengan ukuran sisipan yang diambil dari sampel
distribusi normal. Orientasi baca adalah innies. Outputnya adalah file FASTQ yang disisipkan.
posisi argumen:
infile Nama file input
file keluar
Nama file keluaran
ukuran sisipan rata-rata:
Rata-rata ukuran sisipan pasangan baca
masukkan deviasi std
Devasi standar ukuran insert
cakupan berarti
Cakupan rata-rata dari bacaan
panjang baca
Panjang setiap bacaan
opsional argumen:
-h, --membantu
tunjukkan pesan bantuan ini dan keluar
--fragmen NAMA FILE
Tulis urutan fragmen FASTA (yaitu pasangan baca ditambah urutan di antaranya)
ke nama file yang diberikan
--non Jangan izinkan karakter N atau n apa pun dalam bacaan
--benih INT
Benih untuk generator nomor acak. Defaultnya adalah menggunakan default python
Gunakan fastaq-to_perfect_reads online menggunakan layanan onworks.net
