gamgi - Online di Awan

PROGRAM:

NAMA

gamgi - antarmuka grafis pemodelan atomistik umum

RINGKASAN

gamgi [file_1.xml] ... [file_n.xml]

DESKRIPSI

gamgi adalah paket komputer untuk membangun, melihat dan menganalisis struktur atom.

PILIHAN

file_n.xml adalah nama lengkap seperti:

../dat/molekul/rasa/bawang putih.xml
~/gamgi/dat/molecule/flavours/garlic.xml
http://www.gamgi.org/dat/molecule/flavors/garlic.xml
ftp://ftp.gamgi.org/gamgi/dat/molecule/flavors/garlic.xml

Data objek dan konfigurasi dapat dicampur, jadi file_1.xml mungkin file preferensi, dimuat
sebelum file objek lainnya. Untuk mengotomatiskan prosedur, cukup tambahkan baris seperti ini ke
~ / .bashrc:

alias gamgi='gamgi ~/gamgi/my_defaults.xml'

LINGKUNGAN

GAMGI_BANTUAN
Setel variabel ini untuk memberi tahu GAMGI di mana file dokumentasi Bantuan berada. Untuk
contoh, tambahkan baris seperti ini ke ~ / .bashrc :

GAMGI_BANTUAN=~/gamgi/gamgi/doc; ekspor GAMGI_BANTUAN

GAMGI_TEXT
Setel variabel ini untuk memberi tahu GAMGI di mana file .ttf DejaVu, untuk dirender
font padat. Misalnya, tambahkan baris seperti ini ke ~ / .bashrc:

GAMGI_TEXT=~/gamgi/gamgi/src/io/fonts; ekspor GAMGI_TEXT

BROWSER
Setel variabel ini untuk memberi tahu GAMGI browser mana yang akan diluncurkan, jika ini yang dipilih
untuk membaca Bantuan. Misalnya, tambahkan baris seperti ini ke ~ / .bashrc:

PERAMBIL=firefox; ekspor BROWSER

MEMBANTU

Baca informasi pengantar dengan Help->Start. Jelajahi dokumentasi di
http://www.gamgi.org/ atau salinan lokalnya di gamgi/dok/. Gunakan mekanisme bantuan bersatu kembali
di bawah tombol Bantuan. Berlangganan milis[email dilindungi]>.

Hubungi penulis di[email dilindungi]>.

Sepanjang semua antarmuka dan format, panjang dalam angstrom, sudut dalam derajat dan
bilangan desimal dilambangkan dengan titik. Setiap parameter yang dapat didefinisikan dalam suatu
antarmuka dapat juga didefinisikan dalam file dan sebaliknya.

INTERFACES

Putar, pindahkan, skala objek yang dipilih dengan menekan tombol kiri, tengah, kanan mouse.
Ekspor objek yang dipilih dengan memilih File->Export. Bilah status menunjukkan objek yang dipilih
(kiri) dan lapisan (kanan).

Untuk memilih objek, pilih Object->Select dan tekan objek. Atau pilih objeknya
class pada menu di atas, dengan tombol tengah, sebelum menekan objek. Atau tekan
dua kali Layer, Window atau GAMGI pada menu di atas. Ketika objek tidak memiliki visual
representasi, tekan mouse di atas area grafik, untuk memunculkan menu.

Untuk memilih layer, pilih Layer->Select dan tekan mouse di atas area grafik, untuk pop
sebuah menu. Atau pilih kelas layer pada menu di atas, dengan tombol tengah, sebelumnya
menekan mouse di atas area grafik, untuk memunculkan menu.

Benda padat biasanya membutuhkan lampu dengan komponen difus dan specular agar benar
direpresentasikan dalam ruang 3D, jika tidak mereka akan terlihat datar. Objek berkabel tidak memiliki 3D
representasi, sehingga cahaya yang menyebar dan specular tidak dipantulkan, menjadi kurang terlihat
saat menggunakan lampu, kecuali jika komponen lingkungan yang signifikan digunakan. Seringkali layak untuk
menggambar benda padat dan kabel dalam lapisan yang berbeda, dengan dan tanpa lampu.

Saat dialog tugas terbuka, untuk mempelajari cara kerjanya, cukup pilih Bantuan->Saat ini dan lainnya
dialog akan muncul, menjelaskan arti dari semua parameter dalam dialog tugas.

Untuk melihat penjelasan rinci tentang antarmuka GAMGI, lihat manual referensi di
http://www.gamgi.org/interfaces/reference.html, doc/interfaces/reference.html or
Bantuan->Topik->Antarmuka.

FORMAT

GAMGI dapat mengimpor file di .XYZ dan . Xml format asli, dipilih secara otomatis oleh file
perpanjangan. GAMGI dapat mengekspor file dalam .ps, .ppm, .jp[e]g, . Png, .bertengkar], .x3d Dan asli
. Xml format, dipilih secara otomatis oleh ekstensi file.

Dalam format XML asli GAMGI, molekul air dapat digambarkan sebagai:












Untuk melihat penjelasan rinci tentang format GAMGI, lihat manual referensi di
http://www.gamgi.org/formats/reference.html, doc/formats/reference.html or
Bantuan->Topik->Format.

CONTOH

Pilih Bantuan->Tutorial untuk mendapatkan daftar prosedur yang dijelaskan sepenuhnya, yang paling banyak dicontohkan
aspek pekerjaan dengan GAMGI.

Gunakan gamgi online menggunakan layanan onworks.net