gbrowse - Daring di Awan

PROGRAM:

NAMA

GBrowse2 - Peramban Genom Generik

RINGKASAN

libgbrowse-perl [-H]

INSTALASI

Jika Apache2 diinstal pada sistem, perangkat lunak telah mengonfigurasinya untuk menautkan URL ke
GBrowse direktori. Restart Apache diperlukan untuk memperhitungkannya.
Konfigurasi tersedia di file /etc/gbrowse2/apache2.conf.
Jika server web lain digunakan, seseorang harus merujuk ke templat Apache2 untuk memetakan url di
cara yang sama.

KETERGANTUNGAN

Ketergantungan Perl opsional tambahan ada untuk menyediakan fitur tambahan. Silakan lihat
ke modul Opsional dalam file INSTALL untuk informasi lebih lanjut.

KONFIGURASI

growse2 File konfigurasi terletak di /etc/gbrowse. File konfigurasi utama adalah
GBrowse.conf. Ini berisi elemen konfigurasi global. File konfigurasi khusus
terletak di direktori yang sama per bank data. Untuk lebih jelasnya, seseorang harus merujuk ke
Dokumentasi GBrowse.
Instalasi disediakan dengan sampel genom Ragi.

DESKRIPSI

GBrowse sederhana tapi sangat
browser genom berbasis web yang dapat dikonfigurasi. Ini adalah komponen dari
Proyek Database Sistem Organisme Model Generik (GMOD).
Beberapa fiturnya:
* Mata burung simultan dan pandangan rinci genom;
* Gulir, perbesar, tengah;
* Lampirkan URL arbitrer ke anotasi apa pun;
* Urutan dan tampilan trek dapat disesuaikan oleh administrator dan
pengguna akhir;
* Cari berdasarkan ID anotasi, nama, atau komentar;
* Mendukung anotasi pihak ketiga menggunakan format GFF;
* Pengaturan bertahan di seluruh sesi;
* Dump DNA dan GFF;
* Konektivitas ke database yang berbeda, termasuk BioSQL dan Chado;
* Dukungan multi-bahasa;
* Pemuatan fitur pihak ketiga;
* Arsitektur plug-in yang dapat disesuaikan (misalnya menjalankan BLAST, membuang & mengimpor banyak
format, temukan oligonukleotida, desain primer, buat peta pembatasan,
mengedit fitur).

WEB TRANSPORTASI

GBrowse dapat diakses di URL http://localhost/gbrowse2

Gunakan gbrowse online menggunakan layanan onworks.net