Ini adalah perintah gmod_fasta2gff3.plp yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator atau MAC OS online emulator
PROGRAM:
NAMA
$O - Konversi FASTA ke GFF3 sederhana
SINOPSIS
% $O [opsi]
GARIS KOMANDO PILIHAN
--fasta_dir Direktori berisi file fasta
(default: ./fasta)
--gfffilename Nama file GFF3 yang akan dibuat
(standar: ./out.gff)
--ketik tipe SO untuk ditetapkan ke setiap fitur
(bawaan: EST)
--source Teks untuk muncul di kolom sumber
(bawaan: .)
--attributes Tag tambahan=pasangan nilai muncul di kolom 9
--nosequence Menekan bagian ##FASTA (yaitu, jangan
mencetak urutan DNA)
DESKRIPSI
Skrip ini hanya mengambil kumpulan file fasta dan mengonversinya menjadi GFF3 sederhana
cocok untuk dimuat ke chado.
PENULIS
Scott Cain[email dilindungi]>
Hak Cipta (c) 2006
Perpustakaan ini adalah perangkat lunak gratis; Anda dapat mendistribusikan ulang dan/atau memodifikasinya di bawah yang sama
istilah sebagai Perl itu sendiri.
Gunakan gmod_fasta2gff3.plp online menggunakan layanan onworks.net
