Ini adalah perintah go-show-paths-to-rootp yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator atau MAC OS online emulator
PROGRAM:
NAMA
go-show-paths-to-root.pl - menunjukkan semua kemungkinan jalur dari istilah ke atas
RINGKASAN
go-show-paths-to-root.pl -id GO:0008021 ontologi/gene_ontology.obo
go-show-paths-to-root.pl -names -id GO:0008021 ontologi/gene_ontology.obo
DESKRIPSI
melintasi DAG yang menunjukkan semua jalur (istilah dan hubungan intervensi) ke root
Script ini murni berbasis file; itu perlu mengurai ontologi setiap kali
Penguraian selanjutnya dapat dipercepat menggunakan opsi use_cache
Jika Anda ingin menggunakan GO MySQL db, lihat skrip go-db-show-paths-to-root.pl di go-
distribusi db-perl
ARGUMEN
-e ERFILE
menulis kesalahan penguraian dalam XML - default ke STDERR (seharusnya tidak ada kesalahan penguraian dalam sumur
file yang dibentuk)
-p FORMAT
menentukan parser mana yang akan digunakan; jika dibiarkan tidak ditentukan, akan membuat tebakan berdasarkan file
akhiran. Lihat di bawah untuk format
-gunakan_cache
Jika sakelar ini ditentukan, maka mode caching diaktifkan.
Dengan mode caching, pertama kali Anda mengurai file, maka file tambahan akan menjadi
diekspor dalam format khusus yang cepat diurai. File ini akan memiliki nama file yang sama
sebagai file asli, kecuali itu akan memiliki akhiran ".cache".
Lain kali Anda mengurai file, program ini akan secara otomatis memeriksa keberadaannya
dari file ".cache". Jika ada, dan lebih baru dari file yang Anda tentukan, ini
diuraikan sebagai gantinya. Jika tidak ada, itu dibangun kembali.
DOKUMENTASI
<http://www.godatabase.org/dev>
Gunakan go-show-paths-to-rootp online menggunakan layanan onworks.net
