Ini adalah perintah hmm-assembler.pl yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
hmm-assembler.pl - modul SNAP hmm-assembler.pl
RINGKASAN
hmm-assembler.pl [-PILIHAN [-LEBIH BANYAK PILIHAN]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
PILIHAN
Grafik berikut karakter tunggal Pilihan adalah diterima:
Dengan argumen: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Boolean (tanpa argumen): -r -o -x -p -t -1
Opsi dapat digabungkan bersama. -- menghentikan pemrosesan opsi. Ruang tidak diperlukan
antara pilihan dan argumen mereka.
Pilihan:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] termasuk model 3'UTR, membutuhkan -a
-a [] termasuk model PolyA, membutuhkan -3
-5 [] termasuk 5'UTR moel, membutuhkan -p
-p termasuk model promotor generik, membutuhkan -5
-r termasuk model pengulangan generik
-o termasuk model ORF terbalik
-x gunakan model intron durasi eksplisit
-t termasuk C.elegans trans-splicing, membutuhkan -p, -5
-Z menetapkan nilai spesifik clade (cacing, lalat, tanaman)
-1 model gen tunggal
-c
termasuk model donor sambungan GC-AG
Gunakan hmm-assembler.pl online menggunakan layanan onworks.net