Ini adalah perintah ltrsift yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
ltrift - antarmuka grafis untuk pascapemrosesan dan klasifikasi LTR
kandidat retrotransposon
RINGKASAN
ltrift
DESKRIPSI
LTRsift adalah alat desktop grafis untuk postprocessing semi-otomatis dari prediksi de novo
Anotasi retrotransposon LTR, seperti yang dihasilkan oleh LTRharvest dan LTRdigest.
KONFIGURASI
Binari LAST (lastal dan lastdb) harus ditempatkan di jalur pencarian sistem. Jika mereka
tidak, apakah mungkin untuk menentukan lokasi mereka menggunakan lingkungan "GT_LAST_PATH"
variabel sebelum menjalankan LTRsift. Hal yang sama berlaku untuk lokasi BLAST. Menggunakan
``GT_BLAST_PATH" untuk menentukan path lengkap ke "blastall" yang dapat dieksekusi.
File gaya (menggambarkan bagaimana diagram linier dari fitur kandidat terlihat) dapat
diatur melalui variabel lingkungan LTRSIFT_STYLE_FILE. Gaya default yang masuk akal dibangun
ke dalam LTR-sift.
Gunakan ltrsift online menggunakan layanan onworks.net