Ini adalah perintah mia-3dmany2one-nonrigid yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator atau MAC OS online emulator
PROGRAM:
NAMA
mia-3dmany2one-nonrigid - Pendaftaran rangkaian gambar 3D
RINGKASAN
mia-3dmany2one-tidak kaku -i [pilihan]
DESKRIPSI
mia-3dmany2one-tidak kaku Program ini menjalankan pendaftaran seri gambar yang tidak kaku dengan
mendaftarkan semua gambar ke referensi yang dipilih pengguna.
PILIHAN
File-IO
-i --in-file=(masukan, diperlukan); io
masukan kumpulan data perfusi Untuk jenis file yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/io
-o --out-file=(keluaran); io
nama file untuk file terdaftar Untuk jenis file yang didukung lihat
PLUGIN:3dimage/io
Pendaftaran
-O --optimizer=gsl:opt=gd,langkah=0.1
Pengoptimal digunakan untuk meminimalkan
-l --mg-level=3
level multi-resolusi level multi-resolusi
-f --transForm=spline
tipe transformasi tipe transformasi Untuk plugin yang didukung, lihat
PLUGIN:3dimage/transform
-r --ref=-1
bingkai referensi (-1 == gunakan gambar di tengah) bingkai referensi (-1 == gunakan
gambar di tengah)
Bantuan & Info
-V --verbose=peringatan
verbositas output, pesan cetak dari tingkat tertentu dan prioritas yang lebih tinggi.
Prioritas yang didukung mulai dari level terendah adalah:
Info - Pesan tingkat rendah
jejak - Jejak panggilan fungsi
gagal - Laporkan kegagalan pengujian
peringatan - Peringatan
kesalahan - Laporkan kesalahan
men-debug - Keluaran debug
pesan - Pesan biasa
fatal - Laporkan hanya kesalahan fatal
--hak cipta
cetak informasi hak cipta
-h --bantuan
cetak bantuan ini
-? --penggunaan
cetak bantuan singkat
--Versi: kapan
cetak nomor versi dan keluar
Pengolahan
--utas=-1
Jumlah maksimum utas yang digunakan untuk pemrosesan, Jumlah ini harus lebih rendah
atau sama dengan jumlah inti prosesor logis dalam mesin. (-1:
estimasi otomatis). Jumlah utas maksimum yang digunakan untuk pemrosesan, Ini
nomor harus lebih rendah atau sama dengan jumlah inti prosesor logis di
mesin. (-1: estimasi otomatis).
PLUGIN: 1d/kernel spasial
cdiff Kernel filter perbedaan pusat, kondisi batas cermin digunakan.
(tidak ada parameter)
gauss kernel filter Gauss spasial, parameter yang didukung adalah:
w = 1; uint di [0, inf)
setengah lebar filter.
PLUGIN: 1 hari/splinebc
cermin Kondisi batas interpolasi spline yang mencerminkan batas
(tidak ada parameter)
ulangi Kondisi batas interpolasi spline yang mengulang nilai pada batas
(tidak ada parameter)
nol Kondisi batas interpolasi spline yang mengasumsikan nol untuk nilai di luar
(tidak ada parameter)
PLUGIN: 1d/kernel spline
bspline Pembuatan kernel B-spline, parameter yang didukung adalah:
d = 3; int di [0, 5]
Gelar spline.
omm Pembuatan kernel OMoms-spline, parameter yang didukung adalah:
d = 3; int di [3, 3]
Gelar spline.
PLUGIN: 3dimage/penggabung
perut buncit Penggabung gambar 'absdiff'
(tidak ada parameter)
menambahkan Penggabung gambar 'tambah'
(tidak ada parameter)
div Penggabung gambar 'div'
(tidak ada parameter)
mul Penggabung gambar 'mul'
(tidak ada parameter)
di bawah Penggabung gambar 'sub'
(tidak ada parameter)
PLUGIN: 3dgambar/biaya
lncc korelasi silang lokal yang dinormalisasi dengan dukungan masking., Parameter yang didukung
adalah:
w = 5; uint di [1, 256]
setengah lebar jendela yang digunakan untuk mengevaluasi salib lokal
korelasi.
mi Informasi timbal balik berbasis parzen spline., parameter yang didukung adalah:
memotong = 0; mengapung di [0, 40]
Persentase piksel yang akan dipotong pada intensitas tinggi dan rendah untuk dihapus
outlier.
mbin = 64; uint di [1, 256]
Jumlah histogram bin yang digunakan untuk gambar bergerak.
mkernel = [bspline:d=3]; pabrik
Spline kernel untuk memindahkan gambar parzen hinstogram. Untuk plug-in yang didukung
lihat PLUGIN:1d/splinekernel
rbin = 64; uint di [1, 256]
Jumlah bin histogram yang digunakan untuk gambar referensi.
kernel = [bspline:d=0]; pabrik
Spline kernel untuk parzen hinstogram gambar referensi. Untuk plug-
in lihat PLUGIN: 1d/splinekernel
NCC korelasi silang yang dinormalisasi.
(tidak ada parameter)
ngf Fungsi ini mengevaluasi kesamaan gambar berdasarkan gradien yang dinormalisasi
bidang. Diberikan bidang gradien yang dinormalisasi $ _S$ dari gambar src dan $ _R$ dari
ref image berbagai evaluator diimplementasikan., parameter yang didukung adalah:
evaluasi = ds; dikte
subtipe plugin (sq, ds, dot, cross). Nilai yang didukung adalah:
ds - kuadrat selisih skala
dot - kernel produk skalar
menyeberang - kernel lintas produk
SSD Biaya gambar 3D: jumlah perbedaan kuadrat, parameter yang didukung adalah:
pengikisan otomatis = 0; mengapung di [0, 1000]
Gunakan masking otomatis dari gambar bergerak dengan hanya mengambil nilai intensitas
ke akun yang lebih besar dari ambang batas yang diberikan.
norma = 0; bodoh
Setel apakah metrik harus dinormalisasi dengan jumlah piksel gambar.
ssd-automask
Biaya gambar 3D: jumlah perbedaan kuadrat, dengan penyamaran otomatis berdasarkan yang diberikan
ambang batas, parameter yang didukung adalah:
mengirik = 0; dobel
Nilai intensitas ambang batas untuk gambar referensi.
mengirik = 0; dobel
Nilai intensitas ambang batas untuk gambar sumber.
PLUGIN: 3dgambar/filter
bandpass filter bandpass intensitas, parameter yang didukung adalah:
max = 3.40282e+38; mengambang
maksimal dari band.
menit = 0; mengambang
minimal dari band.
binarisasi filter binerisasi gambar, parameter yang didukung adalah:
max = 3.40282e+38; mengambang
jangkauan maksimum yang diterima.
menit = 0; mengambang
rentang minimum yang diterima.
menutup penjualan morfologi dekat, parameter yang didukung adalah:
mengisyaratkan = hitam; rangkaian
petunjuk tentang konten gambar utama (hitam|putih).
bentuk = [bola:r=2]; pabrik
elemen penataan. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/shape
Combiner Gabungkan dua gambar dengan operator penggabung yang diberikan. jika 'terbalik' diatur ke
false, operator pertama adalah gambar yang melewati pipa filter, dan
gambar kedua diambil dari file yang diberikan dengan parameter 'gambar' the
saat filter dijalankan., parameter yang didukung adalah:
gambar =(masukan, diperlukan, string)
gambar kedua yang dibutuhkan dalam combiner.
op = (wajib, pabrik)
Penggabung gambar untuk diterapkan pada gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 3dimage/combiner
membalikkan = 0; bodoh
membalikkan urutan gambar yang diteruskan ke penggabung.
mengubah filter konversi format piksel gambar, parameter yang didukung adalah:
a = 1; mengambang
parameter konversi linier a.
b = 0; mengambang
parameter konversi linier b.
peta = memilih; dikte
pemetaan konversi. Nilai yang didukung adalah:
memilih - menerapkan transformasi linier yang memetakan rentang input nyata ke
rentang keluaran penuh
jarak – menerapkan transformasi linier yang memetakan tipe data input
rentang ke rentang tipe data keluaran
salinan - salin data saat mengonversi
linear – terapkan transformasi linier x -> a*x+b
optstat - menerapkan transformasi linier yang memetakan berdasarkan mean input dan
variasi ke kisaran output penuh
perwakilan = ubita; dikte
jenis piksel keluaran. Nilai yang didukung adalah:
tak satupun - tidak ada tipe piksel yang ditentukan
mengapung - titik mengambang 32 bit
sedikit - ditandatangani 8 bit
ulong - 64 bit yang tidak ditandatangani
dua kali lipat - titik mengambang 64 bit
Sint - ditandatangani 32 bit
pendek - 16 bit yang tidak ditandatangani
pendek - ditandatangani 16 bit
tidak - 32 bit yang tidak ditandatangani
panjang - ditandatangani 64 bit
sedikit – data biner
ubyte - 8 bit yang tidak ditandatangani
tanaman Pangkas wilayah gambar, wilayah selalu dijepit ke gambar asli
ukuran dalam arti bahwa rentang yang diberikan disimpan., parameter yang didukung adalah:
akhir = [[4294967295,4294967295,4294967295]]; dapat dialirkan
akhir rentang tanam, maksimum = (-1,-1,-1).
awal = [[0,0,0]]; dapat dialirkan
mulai dari jangkauan tanam.
melebarkan Filter pelebaran tumpukan gambar 3d, parameter yang didukung adalah:
mengisyaratkan = hitam; rangkaian
petunjuk tentang konten gambar utama (hitam|putih).
bentuk = [bola:r=2]; pabrik
elemen penataan. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/shape
jarak Mengevaluasi transformasi jarak 3D dari sebuah gambar. Jika gambar adalah topeng biner,
maka hasil transformasi jarak di setiap titik sesuai dengan Euclidian
jarak ke topeng. Jika citra masukan berupa nilai piksel skalar, maka
skalar ini diinterpretasikan sebagai bidang tinggi dan nilai per piksel menambah
jarak.
(tidak ada parameter)
skala kecil Turunkan gambar input dengan menggunakan ukuran blok yang diberikan untuk menentukan skala bawah
faktor. Sebelum penskalaan, gambar disaring oleh filter pemulusan untuk
menghilangkan data frekuensi tinggi dan menghindari artifak aliasing., didukung
parameter adalah:
b = [[1,1,1]]; 3dbound
Ukuran blok.
bx = 1; uint di [1, inf)
blocksize dalam arah x.
by = 1; uint di [1, inf)
ukuran blok dalam arah y.
bz = 1; uint di [1, inf)
ukuran blok dalam arah z.
inti = gauss; rangkaian
menghaluskan kernel filter yang akan diterapkan, ukuran filter diperkirakan
berdasarkan ukuran blok..
mengikis Filter pengikisan tumpukan gambar 3d, parameter yang didukung adalah:
mengisyaratkan = hitam; rangkaian
petunjuk tentang konten gambar utama (hitam|putih).
bentuk = [bola:r=2]; pabrik
elemen penataan. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/shape
gauss filter gauss 3D isotropik, parameter yang didukung adalah:
w = 1; int dalam [0, inf)
parameter lebar filter.
kelulusan Gambar 3D ke filter norma gradien
(tidak ada parameter)
topeng tumbuh Gunakan topeng biner input dan gambar skala abu-abu referensi untuk melakukan pengembangan wilayah
dengan menambahkan piksel tetangga dari piksel yang sudah ditambahkan jika memiliki lebih rendah
intensitas yang berada di atas ambang batas yang diberikan., parameter yang didukung adalah:
menit = 1; mengambang
ambang batas yang lebih rendah untuk pertumbuhan topeng.
ref =(masukan, diperlukan, string)
gambar referensi untuk pertumbuhan wilayah topeng.
bentuk = 6n; pabrik
topeng tetangga. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/shape
membalikkan filter pembalikan intensitas
(tidak ada parameter)
isovoksel Filter ini menskalakan gambar untuk membuat ukuran voxel menjadi isometrik dan ukurannya menjadi
sesuai dengan nilai yang diberikan, parameter yang didukung adalah:
interp = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolasi yang akan digunakan. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
ukuran = 1; mengapung di (0, inf)
ukuran voxel target isometrik.
km berarti Gambar 3D k-means filter. Pada gambar keluaran nilai piksel mewakili
keanggotaan kelas dan pusat kelas disimpan sebagai atribut dalam gambar.,
parameter yang didukung adalah:
c = 3; int dalam [2, inf)
jumlah kelas.
label Filter untuk memberi label komponen yang terhubung dari gambar biner., didukung
parameter adalah:
n = 6n; pabrik
topeng tetangga. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/shape
peta label Filter gambar untuk memetakan ulang id label. Hanya berlaku untuk gambar dengan nilai integer
intensitas/label., parameter yang didukung adalah:
peta =(masukan, diperlukan, string)
File pemetaan label.
skala label
Filter yang hanya membuat voxel keluaran yang sudah dibuat di input
gambar. Scaling dilakukan dengan menggunakan algoritma voting yang memilih target
nilai piksel berdasarkan jumlah piksel tertinggi dari label tertentu di
wilayah sumber yang sesuai. Jika wilayah tersebut terdiri dari dua label dengan label yang sama
hitung, yang dengan angka lebih rendah menang., parameter yang didukung adalah:
ukuran luar =(wajib, 3dbounds)
ukuran target diberikan sebagai dua nilai yang dipisahkan koma.
memuat Muat gambar input dari file dan gunakan untuk mengganti gambar saat ini di
pipeline., parameter yang didukung adalah:
fillet =(masukan, diperlukan, string)
nama file input untuk memuat dari..
lvdownscale
Ini adalah filter skala bawah voting label. Ini menurunkan skala gambar 3D dengan blok.
Untuk setiap blok, label (bukan nol) yang paling sering muncul di blok adalah
dikeluarkan sebagai piksel keluaran pada gambar target. Jika dua label muncul dengan angka yang sama
kali, yang dengan nilai absolut lebih rendah menang., parameter yang didukung adalah:
b = [[1,1,1]]; 3dbound
blocksize untuk downscaling. Setiap blok akan diwakili oleh satu piksel
di gambar sasaran..
masker Menutupi gambar, satu gambar diambil dari daftar parameter dan yang lainnya dari
masukan filter biasa. Kedua gambar harus memiliki dimensi yang sama dan salah satunya harus
menjadi biner. Atribut gambar yang datang melalui pipa filter adalah
diawetkan. Jenis piksel keluaran sesuai dengan gambar masukan yang tidak
binary., parameter yang didukung adalah:
memasukkan =(masukan, diperlukan, string)
nama file gambar masukan kedua.
berarti Filter rata-rata gambar 3D, parameter yang didukung adalah:
w = 1; int dalam [1, inf)
setengah lebar filter.
rata-rata filter 3d median, parameter yang didukung adalah:
w = 1; int dalam [1, inf)
parameter lebar filter.
mlv Rata-rata filter gambar 3D Varian Terkecil, parameter yang didukung adalah:
w = 1; int dalam [1, inf)
parameter lebar filter.
msnormalizer
Filter normalisasi mean-sigma gambar 3D, parameter yang didukung adalah:
w = 1; int dalam [1, inf)
setengah lebar filter.
Buka morfologi terbuka, parameter yang didukung adalah:
mengisyaratkan = hitam; rangkaian
petunjuk tentang konten gambar utama (hitam|putih).
bentuk = [bola:r=2]; pabrik
elemen penataan. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/shape
reorientasi Filter reorientasi gambar 3D, parameter yang didukung adalah:
peta = xyz; dikte
pemetaan orientasi yang akan diterapkan. Nilai yang didukung adalah:
p-zxy ‐ permutasi x->y->z->x
r-x180 - putar di sekitar sumbu x searah jarum jam 180 derajat
xyz - tetap orientasi
p-yzx ‐ permutasi x->z->y->x
r-z180 - putar di sekitar sumbu z searah jarum jam 180 derajat
r-y270 - putar di sekitar sumbu y searah jarum jam 270 derajat
f-xz - balik xz
f-yz - balik yz
r-x90 - putar di sekitar sumbu x searah jarum jam 90 derajat
r-y90 - putar di sekitar sumbu y searah jarum jam 90 derajat
r-x270 - putar di sekitar sumbu x searah jarum jam 270 derajat
r-z270 - putar di sekitar sumbu z searah jarum jam 270 derajat
r-z90 - putar di sekitar sumbu z searah jarum jam 90 derajat
f-xy - balik xy
r-y180 - putar di sekitar sumbu y searah jarum jam 180 derajat
mengubah ukuran Mengubah ukuran gambar. Data asli dipusatkan di dalam gambar berukuran baru.,
parameter yang didukung adalah:
ukuran = [[0,0,0]]; dapat dialirkan
ukuran baru gambar ukuran 0 menunjukkan untuk menjaga ukuran untuk
dimensi yang sesuai..
pasir filter 3d garam dan merica, parameter yang didukung adalah:
mengirik = 100; mengapung di [0, inf)
nilai ambang.
w = 1; int dalam [1, inf)
parameter lebar filter.
skala Filter gambar 3D yang diskalakan ke ukuran target tertentu , parameter yang didukung adalah:
interp = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolasi yang akan digunakan. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
s = [[0,0,0]]; 3dbound
ukuran target untuk mengatur semua komponen sekaligus (komponen 0: gunakan gambar input
ukuran).
sx = 0; uint di [0, inf)
ukuran target dalam arah x (0: gunakan ukuran gambar input).
sy = 0; uint di [0, inf)
ukuran target dalam arah y (0:gunakan ukuran gambar input).
sz = 0; uint di [0, inf)
ukuran target dalam arah y (0:gunakan ukuran gambar input).
pilih besar Filter yang membuat topeng biner yang mewakili intensitas dengan yang tertinggi
jumlah piksel. Nilai piksel 0 akan diabaikan, dan jika dua intensitas memiliki
jumlah piksel yang sama, maka hasilnya tidak terdefinisi. Piksel masukan harus memiliki
jenis piksel integral.
(tidak ada parameter)
sepkonv Filter konvolusi pemisah intensitas gambar 3D, parameter yang didukung adalah:
kx = [gauss:w=1]; pabrik
filter kernel dalam arah-x. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/kernel spasial
ky = [gauss:w=1]; pabrik
filter kernel dalam arah y. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/kernel spasial
kz = [gauss:w=1]; pabrik
filter kernel dalam arah-z. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/kernel spasial
sw hulu sungai yang diunggulkan. Algoritme mengekstrak persis begitu banyak reagen sebagai inisial
label diberikan dalam gambar benih., parameter yang didukung adalah:
lulusan = 0; bodoh
Menafsirkan gambar input sebagai gradien. .
tanda = 0; bodoh
Tandai DAS tersegmentasi dengan nilai skala abu-abu khusus.
n = [bola:r=1]; pabrik
Lingkungan untuk wilayah hulu sungai berkembang. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN:3dimage/bentuk
benih =(masukan, diperlukan, string)
gambar input seed yang berisi label untuk region awal.
tee Simpan gambar input ke file dan juga berikan ke filter berikutnya,
parameter yang didukung adalah:
fillet = (keluaran, diperlukan, string)
nama file output untuk menyimpan gambar juga..
penjarangan Penipisan morfologis 3D, berdasarkan: Lee dan Kashyap, 'Membangun Model Kerangka
melalui 3-D Medial Surface/Axis Thinning Algorithms', Model Grafis dan Gambar
Pengolahan, 56(6):462-478, 1994. Implementasi ini hanya mendukung 26
lingkungan.
(tidak ada parameter)
mengubah Transformasikan gambar input dengan transformasi yang diberikan., parameter yang didukung
adalah:
fillet =(masukan, diperlukan, string)
Nama file yang berisi transformasi..
batas img = ; rangkaian
mengesampingkan kondisi batas interpolasi citra.
imgkernel = ; rangkaian
menimpa kernel interpolator gambar.
perbedaan Filter varians gambar 3D, parameter yang didukung adalah:
w = 1; int dalam [1, inf)
setengah lebar filter.
ws segmentasi dasar DAS, parameter yang didukung adalah:
evaluasi = 0; bodoh
Setel ke 1 jika gambar input tidak mewakili gambar norma gradien.
tanda = 0; bodoh
Tandai DAS tersegmentasi dengan nilai skala abu-abu khusus.
n = [bola:r=1]; pabrik
Lingkungan untuk wilayah hulu sungai berkembang. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN:3dimage/bentuk
mengirik = 0; mengapung di [0, 1)
Ambang batas norma gradien relatif. Nilai ambang nilai sebenarnya adalah
ambang * (max_grad - min_grad) + min_grad. Basin dipisahkan oleh gradien
dengan norma yang lebih rendah akan bergabung.
PLUGIN: 3dimage/biaya penuh
gambar Fungsi biaya kesamaan gambar umum yang juga menangani multi-resolusi
pengolahan. Ukuran kesamaan yang sebenarnya diberikan es parameter tambahan.,
parameter yang didukung adalah:
biaya = ssd; pabrik
Kernel fungsi biaya. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/cost
men-debug = 0; bodoh
Simpan hasil perantara untuk debugging.
ref = (masukan, string)
Gambar referensi.
src = (masukan, string)
gambar studi.
berat = 1; mengambang
bobot fungsi biaya.
gambar label
Fungsi biaya kesamaan yang memetakan label dari dua gambar dan menangani label-
melestarikan pemrosesan multi-resolusi., parameter yang didukung adalah:
maxlabel = 256; int di [2, 32000]
jumlah maksimum label yang perlu dipertimbangkan.
ref = (masukan, string)
Gambar referensi.
src = (masukan, string)
gambar studi.
berat = 1; mengambang
bobot fungsi biaya.
gambar bertopeng
Fungsi biaya kesamaan gambar bertopeng umum yang juga menangani multi-
pemrosesan resolusi. Masker yang disediakan harus diisi dengan daerah padat di
pemrosesan multi-resolusi karena jika tidak, informasi topeng mungkin hilang
saat memperkecil gambar. Masker dapat difilter terlebih dahulu - setelah difilter terlebih dahulu
topeng harus dari tipe bit. Topeng referensi dan topeng yang diubah dari
gambar studi digabungkan dengan biner AND. Ukuran kesamaan yang sebenarnya diberikan
es parameter tambahan., parameter yang didukung adalah:
biaya = ssd; pabrik
Kernel fungsi biaya. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 3dimage/maskedcost
ref = (masukan, string)
Gambar referensi.
ref-topeng = (masukan, string)
Masker gambar referensi (biner).
ref-masker-filter = ; pabrik
Filter untuk menyiapkan gambar topeng referensi, outputnya harus biner
image.. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/filter
src = (masukan, string)
gambar studi.
src-topeng = (masukan, string)
Pelajari topeng gambar (biner).
src-topeng-filter = ; pabrik
Filter untuk menyiapkan gambar topeng studi, outputnya harus biner
image.. Untuk plug-in yang didukung, lihat PLUGIN:3dimage/filter
berat = 1; mengambang
bobot fungsi biaya.
taggedsd Mengevaluasi jumlah perbedaan kuadrat ukuran kesamaan dengan menggunakan tiga
pasangan gambar yang ditandai. Nilai fungsi biaya dievaluasi berdasarkan semua gambar
berpasangan, tetapi gradien disusun dengan menyusun komponennya berdasarkan tag
arah., parameter yang didukung adalah:
refx = (masukan, string)
Referensi gambar X-tag.
membantah = (masukan, string)
Gambar referensi Y-tag.
referensi = (masukan, string)
Referensi gambar Z-tag.
srcx = (masukan, string)
Pelajari gambar X-tag.
Scy = (masukan, string)
Pelajari gambar Y-tag.
srcz = (masukan, string)
Pelajari gambar Z-tag.
berat = 1; mengambang
bobot fungsi biaya.
PLUGIN: 3 gambar/io
menganalisa Analisis 7.5 gambar
Ekstensi file yang dikenali: .HDR, .hdr
Jenis elemen yang didukung:
unsigned 8 bit, ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32 bit, floating point 32 bit,
titik mengambang 64 bit
kumpulan data IO virtual ke dan dari kumpulan data internal
Ekstensi file yang dikenali: .@
dikom Seri gambar Dicom sebagai 3D
Ekstensi file yang dikenali: .DCM, .dcm
Jenis elemen yang didukung:
bertanda 16 bit, tidak bertanda 16 bit
hdf5 Gambar 5D HDF3 IO
Ekstensi file yang dikenali: .H5, .h5
Jenis elemen yang didukung:
data biner, bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda,
ditandatangani 32 bit, 32 bit tidak ditandatangani, 64 bit ditandatangani, 64 bit tidak ditandatangani, mengambang
titik 32 bit, titik mengambang 64 bit
inria gambar INRIA
Ekstensi file yang dikenali: .INR, .inr
Jenis elemen yang didukung:
bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda, bertanda 32
bit, 32 bit tidak ditandatangani, titik mengambang 32 bit, titik mengambang 64 bit
mhd MetaIO 3D image IO menggunakan implementasi VTK (eksperimental).
Ekstensi file yang dikenali: .MHA, .MHD, .mha, .mhd
Jenis elemen yang didukung:
bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda, bertanda 32
bit, 32 bit tidak ditandatangani, titik mengambang 32 bit, titik mengambang 64 bit
bagus Gambar 1D NIFTI-3 IO
Ekstensi file yang dikenali: .NII, .nii
Jenis elemen yang didukung:
bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda, bertanda 32
bit, 32 bit yang tidak ditandatangani, 64 bit yang ditandatangani, 64 bit yang tidak ditandatangani, floating point 32
bit, titik mengambang 64 bit
ay Format raster VFF Sun
Ekstensi file yang dikenali: .VFF, .vff
Jenis elemen yang didukung:
unsigned 8 bit, ditandatangani 16 bit
pemandangan Tampilan 3D
Ekstensi file yang dikenali: .V, .VISTA, .v, .vista
Jenis elemen yang didukung:
data biner, bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda,
ditandatangani 32 bit, 32 bit tidak ditandatangani, titik mengambang 32 bit, titik mengambang 64
sedikit
vti Gambar 3D VTK-XML masuk dan keluar (eksperimental).
Ekstensi file yang dikenali: .VTI, .vti
Jenis elemen yang didukung:
bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda, bertanda 32
bit, 32 bit tidak ditandatangani, titik mengambang 32 bit, titik mengambang 64 bit
vtk Gambar 3D VTK warisan masuk dan keluar (eksperimental).
Ekstensi file yang dikenali: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage
Jenis elemen yang didukung:
data biner, bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda,
ditandatangani 32 bit, 32 bit tidak ditandatangani, titik mengambang 32 bit, titik mengambang 64
sedikit
PLUGIN: 3dimage/biaya tertutup
lncc korelasi silang lokal yang dinormalisasi dengan dukungan masking., Parameter yang didukung
adalah:
w = 5; uint di [1, 256]
setengah lebar jendela yang digunakan untuk mengevaluasi salib lokal
korelasi.
mi Informasi timbal balik berbasis parzen spline dengan masking., parameter yang didukung adalah:
memotong = 0; mengapung di [0, 40]
Persentase piksel yang akan dipotong pada intensitas tinggi dan rendah untuk dihapus
outlier.
mbin = 64; uint di [1, 256]
Jumlah histogram bin yang digunakan untuk gambar bergerak.
mkernel = [bspline:d=3]; pabrik
Spline kernel untuk memindahkan gambar parzen hinstogram. Untuk plug-in yang didukung
lihat PLUGIN:1d/splinekernel
rbin = 64; uint di [1, 256]
Jumlah bin histogram yang digunakan untuk gambar referensi.
kernel = [bspline:d=0]; pabrik
Spline kernel untuk parzen hinstogram gambar referensi. Untuk plug-
in lihat PLUGIN: 1d/splinekernel
NCC korelasi silang yang dinormalisasi dengan dukungan masking.
(tidak ada parameter)
SSD Jumlah perbedaan kuadrat dengan masking.
(tidak ada parameter)
PLUGIN: 3dgambar/bentuk
18n Pencipta bentuk 18D lingkungan 3n
(tidak ada parameter)
26n Pencipta bentuk 26D lingkungan 3n
(tidak ada parameter)
6n Pencipta bentuk 6D lingkungan 3n
(tidak ada parameter)
bola Lingkungan bentuk bola tertutup termasuk piksel dalam radius tertentu
r., parameter yang didukung adalah:
r = 2; mengapung di (0, inf)
radius bola.
PLUGIN: 3dimage/transformasi
Dihilangkan Transformasi affine (12 derajat kebebasan), parameter yang didukung adalah:
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
sumburot Transformasi rotasi terbatas (1 derajat kebebasan). Transformasinya adalah
terbatas pada rotasi di sekitar sumbu yang diberikan tentang rotasi yang diberikan
tengah, parameter yang didukung adalah:
sumbu =(wajib, 3dfvektor)
sumbu Perputaran.
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
asal =(wajib, 3dfvektor)
pusat transformasi.
rafin Transformasi affine terbatas (3 derajat kebebasan). Transformasinya adalah
terbatas pada rotasi di sekitar sumbu yang diberikan dan geser di sepanjang dua sumbu
tegak lurus dengan yang diberikan, parameter yang didukung adalah:
sumbu =(wajib, 3dfvektor)
sumbu Perputaran.
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
asal =(wajib, 3dfvektor)
pusat transformasi.
kaku Transformasi kaku, yaitu rotasi dan translasi (enam derajat kebebasan),
parameter yang didukung adalah:
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
asal = [[0,0,0]]; 3dfvektor
Pusat rotasi relatif, yaitu <0.5,0.5,0.5> sesuai dengan pusat
volume.
rotasi Transformasi rotasi (tiga derajat kebebasan), parameter yang didukung adalah:
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
asal = [[0,0,0]]; 3dfvektor
Pusat rotasi relatif, yaitu <0.5,0.5,0.5> sesuai dengan pusat
volume.
tikungan busuk Transformasi terbatas (4 derajat kebebasan). Transformasinya adalah
terbatas pada rotasi di sekitar sumbu x dan y dan pembengkokan sepanjang x
sumbu, independen di setiap arah, dengan pembengkokan meningkat dengan
kuadrat jarak dari sumbu rotasi., parameter yang didukung adalah:
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
tidak = 0; bodoh
Jangan mengoptimalkan rotasi.
asal =(wajib, 3dfvektor)
pusat transformasi.
spline Transformasi bentuk bebas yang dapat dideskripsikan dengan sekumpulan koefisien B-spline
dan kernel B-spline yang mendasarinya., parameter yang didukung adalah:
anisorat = [[0,0,0]]; 3dfvektor
tingkat koefisien anisotropik dalam piksel, nilai nonpositif akan menjadi
ditimpa oleh nilai 'tarif'..
men-debug = 0; bodoh
mengaktifkan output debug tambahan.
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
inti = [bspline:d=3]; pabrik
transformasi spline kernel. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
penalti = ; pabrik
istilah energi hukuman transformasi. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN:3dtransform/splinepenalti
tarif = 10; mengapung di [1, inf)
tingkat koefisien isotropik dalam piksel.
menterjemahkan Terjemahan (tiga derajat kebebasan), parameter yang didukung adalah:
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
vf Plug-in ini mengimplementasikan transformasi yang mendefinisikan terjemahan untuk masing-masing
titik grid yang mendefinisikan domain transformasi., didukung
parameter adalah:
batas img = cermin; pabrik
kondisi batas interpolasi citra. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; pabrik
kernel interpolator gambar. Untuk plug-in yang didukung, lihat
PLUGIN: 1d/splinekernel
PLUGIN: transformasi 3d/io
bbs Biner (non-portabel) serial IO transformasi 3D
Ekstensi file yang dikenali: .bbs
kumpulan data IO virtual ke dan dari kumpulan data internal
Ekstensi file yang dikenali: .@
pemandangan Penyimpanan Vista untuk transformasi 3D
Ekstensi file yang dikenali: .v, .v3dt
xml XML serial IO dari transformasi 3D
Ekstensi file yang dikenali: .x3dt
PLUGIN: 3dtransform/splinepenalti
divcurl penalti divcurl pada transformasi, parameter yang didukung adalah:
keriting = 1; mengapung di [0, inf)
bobot penalti pada curl.
div = 1; mengapung di [0, inf)
bobot penalti pada divergensi.
norma = 0; bodoh
Setel ke 1 jika penalti harus dinormalisasi sehubungan dengan gambar
ukuran.
berat = 1; mengapung di (0, inf)
berat energi penalti.
CONTOH
Daftarkan gambar yang diberikan sebagai file bernomor imagesXXXX.v dengan mengoptimalkan berbasis spline
transformasi dengan laju koefisien 16 piksel menggunakan kombinasi pembobotan
bidang gradien yang dinormalisasi dan SSD sebagai ukuran biaya, dan menghukum transformasi dengan
menggunakan divcurl dengan bobot 2.0. Simpan gambar yang dihasilkan di terdaftarXXXX.v.
mia-3dmany2one-nonrigid -i images0000.v -o terdaftar%04d.v -F spline:rate=16
gambar:biaya=[ngf:eval=ds],berat=2.0 gambar:biaya=ssd,berat=0.1 divcurl:berat=2.0
PENULIS
Gert Wolny
HAK CIPTA
Perangkat lunak ini adalah Hak Cipta (c) 1999-2015 Leipzig, Jerman dan Madrid, Spanyol. Itu datang
dengan BENAR-BENAR TANPA JAMINAN dan Anda dapat mendistribusikannya kembali di bawah ketentuan GNU
LISENSI UMUM UMUM Versi 3 (atau lebih baru). Untuk informasi lebih lanjut, jalankan program dengan
opsi '--hak cipta'.
Gunakan mia-3dmany2one-nonrigid online menggunakan layanan onworks.net
